RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613529.4

RNF34-211, Transcript of ring finger protein 34, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RNF34, Length 1,449 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34-211ENST00000613529 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.84■■■□□ 2.85
RNF34-211ENST00000613529 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.16■■■□□ 2.26
RNF34-211ENST00000613529 ABCC9O60706 1549 aa28.75■■■□□ 2.19
RNF34-211ENST00000613529 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.71■■■□□ 2.03
RNF34-211ENST00000613529 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.55■■■□□ 2
RNF34-211ENST00000613529 NACADO15069 1562 aa27.48■■□□□ 1.99
RNF34-211ENST00000613529 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
RNF34-211ENST00000613529 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.23■■□□□ 1.95
RNF34-211ENST00000613529 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.1■■□□□ 1.93
RNF34-211ENST00000613529 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
RNF34-211ENST00000613529 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.89■■□□□ 1.9
RNF34-211ENST00000613529 SCRIBQ14160 1630 aa26.71■■□□□ 1.87
RNF34-211ENST00000613529 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.69■■□□□ 1.86
RNF34-211ENST00000613529 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.48■■□□□ 1.83
RNF34-211ENST00000613529 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.33■■□□□ 1.81
RNF34-211ENST00000613529 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
RNF34-211ENST00000613529 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.95■■□□□ 1.74
RNF34-211ENST00000613529 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.81■■□□□ 1.72
RNF34-211ENST00000613529 SMARCA4P51532 1647 aa25.49■■□□□ 1.67
RNF34-211ENST00000613529 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
RNF34-211ENST00000613529 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.39■■□□□ 1.66
RNF34-211ENST00000613529 NCAPD3P42695 1498 aa25.37■■□□□ 1.65
RNF34-211ENST00000613529 SMARCA2P51531 1590 aa25.34■■□□□ 1.65
RNF34-211ENST00000613529 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.34■■□□□ 1.65
RNF34-211ENST00000613529 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RNF34-211ENST00000613529 HMGXB3Q12766 1538 aa25.19■■□□□ 1.62
RNF34-211ENST00000613529 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.18■■□□□ 1.62
RNF34-211ENST00000613529 WIZO95785 1651 aa25.06■■□□□ 1.6
RNF34-211ENST00000613529 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
RNF34-211ENST00000613529 NESP48681 1621 aa24.84■■□□□ 1.57
RNF34-211ENST00000613529 ERCC6Q03468 1493 aa24.8■■□□□ 1.56
RNF34-211ENST00000613529 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RNF34-211ENST00000613529 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
RNF34-211ENST00000613529 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.7■■□□□ 1.54
RNF34-211ENST00000613529 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.67■■□□□ 1.54
RNF34-211ENST00000613529 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.59■■□□□ 1.53
RNF34-211ENST00000613529 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.52■■□□□ 1.52
RNF34-211ENST00000613529 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
RNF34-211ENST00000613529 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.49■■□□□ 1.51
RNF34-211ENST00000613529 CUX2O14529 1486 aa24.47■■□□□ 1.51
RNF34-211ENST00000613529 CFTRP13569 1480 aa24.47■■□□□ 1.51
RNF34-211ENST00000613529 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
RNF34-211ENST00000613529 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.39■■□□□ 1.49
RNF34-211ENST00000613529 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.35■■□□□ 1.49
RNF34-211ENST00000613529 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.32■■□□□ 1.48
RNF34-211ENST00000613529 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
RNF34-211ENST00000613529 WDR62O43379 1518 aa24.2■■□□□ 1.46
RNF34-211ENST00000613529 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
RNF34-211ENST00000613529 TOPBP1Q92547 1522 aa23.98■■□□□ 1.43
RNF34-211ENST00000613529 ABCC8Q09428 1581 aa23.95■■□□□ 1.43
RNF34-211ENST00000613529 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.92■■□□□ 1.42
RNF34-211ENST00000613529 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.9■■□□□ 1.42
RNF34-211ENST00000613529 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.86■■□□□ 1.41
RNF34-211ENST00000613529 IFT140Q96RY7 1462 aa23.83■■□□□ 1.41
RNF34-211ENST00000613529 CUX1P39880 1505 aa23.77■■□□□ 1.4
RNF34-211ENST00000613529 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
RNF34-211ENST00000613529 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RNF34-211ENST00000613529 SOGA1O94964 1423 aa23.72■■□□□ 1.39
RNF34-211ENST00000613529 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.71■■□□□ 1.39
RNF34-211ENST00000613529 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.71■■□□□ 1.39
RNF34-211ENST00000613529 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RNF34-211ENST00000613529 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
RNF34-211ENST00000613529 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RNF34-211ENST00000613529 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RNF34-211ENST00000613529 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
RNF34-211ENST00000613529 OSCARQ8IYS5 282 aa23.57■■□□□ 1.36
RNF34-211ENST00000613529 SYNJ1O43426 1573 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF34-211ENST00000613529 TOP2BQ02880 1626 aa23.52■■□□□ 1.36
RNF34-211ENST00000613529 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF34-211ENST00000613529 FBLN2P98095 1184 aa23.49■■□□□ 1.35
RNF34-211ENST00000613529 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.44■■□□□ 1.34
RNF34-211ENST00000613529 WDR97A6NE52 1622 aa23.43■■□□□ 1.34
RNF34-211ENST00000613529 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.42■■□□□ 1.34
RNF34-211ENST00000613529 GRIN2BQ13224 1484 aa23.41■■□□□ 1.34
RNF34-211ENST00000613529 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.39■■□□□ 1.33
RNF34-211ENST00000613529 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RNF34-211ENST00000613529 CHD1O14646 1710 aa23.34■■□□□ 1.33
RNF34-211ENST00000613529 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.33■■□□□ 1.33
RNF34-211ENST00000613529 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
RNF34-211ENST00000613529 PBRM1Q86U86 1689 aa23.31■■□□□ 1.32
RNF34-211ENST00000613529 SYNJ2O15056 1496 aa23.25■■□□□ 1.31
RNF34-211ENST00000613529 TRIM41Q8WV44 630 aa23.17■■□□□ 1.3
RNF34-211ENST00000613529 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.15■■□□□ 1.3
RNF34-211ENST00000613529 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.13■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 KIF27Q86VH2 1401 aa23.13■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 ADAMTS12P58397 1594 aa23.12■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.1■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 GRIN2AQ12879 1464 aa23.09■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 ARHGEF11O15085 1522 aa23.09■■□□□ 1.29
RNF34-211ENST00000613529 IGF1RP08069 1367 aa23.06■■□□□ 1.28
RNF34-211ENST00000613529 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.06■■□□□ 1.28
RNF34-211ENST00000613529 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.01■■□□□ 1.27
RNF34-211ENST00000613529 NUP160Q12769 1436 aa22.98■■□□□ 1.27
RNF34-211ENST00000613529 CEP170Q5SW79 1584 aa22.97■■□□□ 1.27
RNF34-211ENST00000613529 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.93■■□□□ 1.26
RNF34-211ENST00000613529 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF34-211ENST00000613529 CUL7Q14999 1698 aa22.92■■□□□ 1.26
RNF34-211ENST00000613529 ARAP1Q96P48 1450 aa22.9■■□□□ 1.26
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