Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.759e-7■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.759e-7■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 SELENOO-202ENST00000492092 1626 ntTSL 1 (best)30.68■■■□□ 2.59e-7■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.52e-6■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.753e-9■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.523e-8■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.265e-6■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 220.25■□□□□ 0.836e-7■■■■□ 23.4
DROSHAQ9NRR4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.54e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MIB2-215ENST00000502470 780 ntTSL 541.7■■■■■ 4.273e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MIB2-225ENST00000510793 889 ntTSL 534.4■■■■□ 3.13e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MIB2-216ENST00000503789 576 ntTSL 532.05■■■□□ 2.723e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MIB2-230ENST00000514363 592 ntTSL 326.22■■□□□ 1.793e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4A-205ENST00000460768 426 ntTSL 227.73■■■□□ 2.032e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.688e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 429.86■■■□□ 2.378e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 429.14■■■□□ 2.268e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 227.1■■□□□ 1.938e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-205ENST00000586833 558 ntTSL 521.5■■□□□ 1.038e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.948e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TPM4-210ENST00000588507 367 ntTSL 312.41□□□□□ -0.428e-48■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.229e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LMNB1-206ENST00000492190 738 ntTSL 327.22■■□□□ 1.959e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.079e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.999e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 27.72□□□□□ -1.179e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 37.54□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 322.38■■□□□ 1.171e-10■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.139e-11■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.769e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TMC8-207ENST00000591144 772 ntTSL 331.81■■■□□ 2.682e-8■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.721e-9■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-8■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-8■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-8■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.76e-13■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 532.81■■■□□ 2.848e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.679e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.929e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 220.01■□□□□ 0.799e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.349e-7■■■■□ 23.3
DROSHAQ9NRR4 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.932e-6■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.421e-6■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.39e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 332.19■■■□□ 2.749e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.29e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 317.49■□□□□ 0.399e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.196e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 IRGQ-204ENST00000601520 495 ntTSL 319.32■□□□□ 0.686e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.388e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.868e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 528.58■■■□□ 2.178e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 23.2
DROSHAQ9NRR4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.798e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.412e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 523.52■■□□□ 1.362e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 310.47□□□□□ -0.732e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 514.8□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.922e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 52.66□□□□□ -1.982e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 51.87□□□□□ -2.112e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.451e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.451e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD20A19P-201ENST00000420143 641 ntTSL 336.24■■■■□ 3.399e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-213ENST00000534374 540 ntTSL 235.79■■■■□ 3.321e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-206ENST00000474986 860 ntTSL 1 (best)35.04■■■■□ 3.21e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-202ENST00000376899 1042 ntTSL 234.85■■■■□ 3.171e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-206ENST00000463411 1015 ntTSL 234.29■■■■□ 3.082e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-207ENST00000484814 541 ntTSL 333.72■■■□□ 2.991e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.831e-8■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-204ENST00000393546 671 ntTSL 329.02■■■□□ 2.242e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.152e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-216ENST00000506537 636 ntTSL 228.04■■■□□ 2.082e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.867e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-206ENST00000432295 1156 ntTSL 526.68■■□□□ 1.869e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.742e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-215ENST00000506161 759 ntTSL 325.95■■□□□ 1.742e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 PDLIM7-213ENST00000505074 931 ntTSL 325.8■■□□□ 1.722e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.427e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 UVSSA-203ENST00000503548 4819 ntTSL 220.81■□□□□ 0.927e-7■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.99e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.729e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.559e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 217.29■□□□□ 0.362e-12■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-208ENST00000478946 955 ntTSL 310.9□□□□□ -0.669e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.79e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.719e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.849e-10■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-6■■■■□ 23.1
DROSHAQ9NRR4 SYNGAP1-206ENST00000479510 2073 ntTSL 235.8■■■■□ 3.324e-6■■■■□ 23.1
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