RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546206.6

ARL6IP1-202, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ARL6IP1, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP1-202ENST00000546206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.2■■■■□ 3.87
ARL6IP1-202ENST00000546206 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.94■■■■□ 3.18
ARL6IP1-202ENST00000546206 ABCC9O60706 1549 aa34.49■■■■□ 3.11
ARL6IP1-202ENST00000546206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.99■■■□□ 2.87
ARL6IP1-202ENST00000546206 NACADO15069 1562 aa32.89■■■□□ 2.86
ARL6IP1-202ENST00000546206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.88■■■□□ 2.85
ARL6IP1-202ENST00000546206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ARL6IP1-202ENST00000546206 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.58■■■□□ 2.81
ARL6IP1-202ENST00000546206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.37■■■□□ 2.77
ARL6IP1-202ENST00000546206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.37■■■□□ 2.77
ARL6IP1-202ENST00000546206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.2■■■□□ 2.75
ARL6IP1-202ENST00000546206 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.09■■■□□ 2.73
ARL6IP1-202ENST00000546206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.93■■■□□ 2.7
ARL6IP1-202ENST00000546206 SCRIBQ14160 1630 aa31.93■■■□□ 2.7
ARL6IP1-202ENST00000546206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.58■■■□□ 2.65
ARL6IP1-202ENST00000546206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
ARL6IP1-202ENST00000546206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.17■■■□□ 2.58
ARL6IP1-202ENST00000546206 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.97■■■□□ 2.55
ARL6IP1-202ENST00000546206 SMARCA4P51532 1647 aa30.49■■■□□ 2.47
ARL6IP1-202ENST00000546206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
ARL6IP1-202ENST00000546206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.37■■■□□ 2.45
ARL6IP1-202ENST00000546206 NCAPD3P42695 1498 aa30.36■■■□□ 2.45
ARL6IP1-202ENST00000546206 SMARCA2P51531 1590 aa30.28■■■□□ 2.44
ARL6IP1-202ENST00000546206 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.26■■■□□ 2.43
ARL6IP1-202ENST00000546206 HMGXB3Q12766 1538 aa30.19■■■□□ 2.42
ARL6IP1-202ENST00000546206 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.16■■■□□ 2.42
ARL6IP1-202ENST00000546206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
ARL6IP1-202ENST00000546206 WIZO95785 1651 aa29.94■■■□□ 2.38
ARL6IP1-202ENST00000546206 NESP48681 1621 aa29.8■■■□□ 2.36
ARL6IP1-202ENST00000546206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
ARL6IP1-202ENST00000546206 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.73■■■□□ 2.35
ARL6IP1-202ENST00000546206 ERCC6Q03468 1493 aa29.68■■■□□ 2.34
ARL6IP1-202ENST00000546206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.6■■■□□ 2.33
ARL6IP1-202ENST00000546206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
ARL6IP1-202ENST00000546206 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.47■■■□□ 2.31
ARL6IP1-202ENST00000546206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.44■■■□□ 2.3
ARL6IP1-202ENST00000546206 CUX2O14529 1486 aa29.43■■■□□ 2.3
ARL6IP1-202ENST00000546206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.37■■■□□ 2.29
ARL6IP1-202ENST00000546206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
ARL6IP1-202ENST00000546206 CFTRP13569 1480 aa29.25■■■□□ 2.27
ARL6IP1-202ENST00000546206 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.22■■■□□ 2.27
ARL6IP1-202ENST00000546206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.15■■■□□ 2.26
ARL6IP1-202ENST00000546206 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.13■■■□□ 2.25
ARL6IP1-202ENST00000546206 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.12■■■□□ 2.25
ARL6IP1-202ENST00000546206 PRDM2Q13029 1718 aa29.06■■■□□ 2.24
ARL6IP1-202ENST00000546206 WDR62O43379 1518 aa29.05■■■□□ 2.24
ARL6IP1-202ENST00000546206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ARL6IP1-202ENST00000546206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
ARL6IP1-202ENST00000546206 TOPBP1Q92547 1522 aa28.68■■■□□ 2.18
ARL6IP1-202ENST00000546206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.6■■■□□ 2.17
ARL6IP1-202ENST00000546206 ABCC8Q09428 1581 aa28.57■■■□□ 2.16
ARL6IP1-202ENST00000546206 IFT140Q96RY7 1462 aa28.51■■■□□ 2.15
ARL6IP1-202ENST00000546206 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
ARL6IP1-202ENST00000546206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
ARL6IP1-202ENST00000546206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ARL6IP1-202ENST00000546206 CUX1P39880 1505 aa28.39■■■□□ 2.14
ARL6IP1-202ENST00000546206 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP1-202ENST00000546206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.33■■■□□ 2.13
ARL6IP1-202ENST00000546206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.32■■■□□ 2.12
ARL6IP1-202ENST00000546206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.121e-6■■■■□ 22.6
ARL6IP1-202ENST00000546206 SOGA1O94964 1423 aa28.27■■■□□ 2.12
ARL6IP1-202ENST00000546206 OSCARQ8IYS5 282 aa28.18■■■□□ 2.1
ARL6IP1-202ENST00000546206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
ARL6IP1-202ENST00000546206 WDR97A6NE52 1622 aa28.11■■■□□ 2.09
ARL6IP1-202ENST00000546206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
ARL6IP1-202ENST00000546206 SYNJ1O43426 1573 aa28.07■■■□□ 2.08
ARL6IP1-202ENST00000546206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.07■■■□□ 2.08
ARL6IP1-202ENST00000546206 CHD1O14646 1710 aa28.06■■■□□ 2.08
ARL6IP1-202ENST00000546206 TOP2BQ02880 1626 aa28.05■■■□□ 2.08
ARL6IP1-202ENST00000546206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28■■■□□ 2.07
ARL6IP1-202ENST00000546206 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.99■■■□□ 2.07
ARL6IP1-202ENST00000546206 FBLN2P98095 1184 aa27.96■■■□□ 2.07
ARL6IP1-202ENST00000546206 TRIM41Q8WV44 630 aa27.96■■■□□ 2.07
ARL6IP1-202ENST00000546206 GRIN2BQ13224 1484 aa27.95■■■□□ 2.07
ARL6IP1-202ENST00000546206 PBRM1Q86U86 1689 aa27.94■■■□□ 2.06
ARL6IP1-202ENST00000546206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.94■■■□□ 2.06
ARL6IP1-202ENST00000546206 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.94■■■□□ 2.06
ARL6IP1-202ENST00000546206 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ARL6IP1-202ENST00000546206 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.82■■■□□ 2.04
ARL6IP1-202ENST00000546206 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.82■■■□□ 2.04
ARL6IP1-202ENST00000546206 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.82■■■□□ 2.04
ARL6IP1-202ENST00000546206 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
ARL6IP1-202ENST00000546206 SYNJ2O15056 1496 aa27.81■■■□□ 2.04
ARL6IP1-202ENST00000546206 ARHGEF11O15085 1522 aa27.77■■■□□ 2.04
ARL6IP1-202ENST00000546206 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.71■■■□□ 2.03
ARL6IP1-202ENST00000546206 ADAMTS12P58397 1594 aa27.69■■■□□ 2.02
ARL6IP1-202ENST00000546206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.64■■■□□ 2.02
ARL6IP1-202ENST00000546206 GRIN2AQ12879 1464 aa27.62■■■□□ 2.01
ARL6IP1-202ENST00000546206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.59■■■□□ 2.01
ARL6IP1-202ENST00000546206 ARAP1Q96P48 1450 aa27.55■■■□□ 2
ARL6IP1-202ENST00000546206 CEP170Q5SW79 1584 aa27.53■■■□□ 2
ARL6IP1-202ENST00000546206 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.53■■■□□ 2
ARL6IP1-202ENST00000546206 NUP160Q12769 1436 aa27.5■■□□□ 1.99
ARL6IP1-202ENST00000546206 KIF27Q86VH2 1401 aa27.48■■□□□ 1.99
ARL6IP1-202ENST00000546206 IGF1RP08069 1367 aa27.44■■□□□ 1.98
ARL6IP1-202ENST00000546206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.38■■□□□ 1.97
ARL6IP1-202ENST00000546206 CUL7Q14999 1698 aa27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP1-202ENST00000546206 SHROOM2Q13796 1616 aa27.34■■□□□ 1.97
ARL6IP1-202ENST00000546206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP1-202ENST00000546206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms