RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502470.5

MIB2-215, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 5

Gene MIB2, Length 780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-215ENST00000502470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.05■■■■■ 8.32
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MIB2-215ENST00000502470 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.67■■■■■ 6.66
MIB2-215ENST00000502470 NACADO15069 1562 aa56.44■■■■■ 6.63
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MIB2-215ENST00000502470 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.86■■■■■ 6.53
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MIB2-215ENST00000502470 SCRIBQ14160 1630 aa54.66■■■■■ 6.34
MIB2-215ENST00000502470 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.27■■■■■ 6.28
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MIB2-215ENST00000502470 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.57■■■■■ 6.17
MIB2-215ENST00000502470 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.26■■■■■ 6.12
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MIB2-215ENST00000502470 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.67■■■■■ 5.86
MIB2-215ENST00000502470 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.84
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MIB2-215ENST00000502470 NESP48681 1621 aa51.1■■■■■ 5.77
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MIB2-215ENST00000502470 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.84■■■■■ 5.73
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MIB2-215ENST00000502470 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.45■■■■■ 5.67
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MIB2-215ENST00000502470 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.01■■■■■ 5.6
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MIB2-215ENST00000502470 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.92■■■■■ 5.58
MIB2-215ENST00000502470 WDR62O43379 1518 aa49.9■■■■■ 5.58
MIB2-215ENST00000502470 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.89■■■■■ 5.58
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MIB2-215ENST00000502470 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.01■■■■■ 5.44
MIB2-215ENST00000502470 ABCC8Q09428 1581 aa49■■■■■ 5.43
MIB2-215ENST00000502470 IFT140Q96RY7 1462 aa48.92■■■■■ 5.42
MIB2-215ENST00000502470 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
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MIB2-215ENST00000502470 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.38
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MIB2-215ENST00000502470 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.44■■■■■ 5.35
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MIB2-215ENST00000502470 CHD1O14646 1710 aa48.2■■■■■ 5.31
MIB2-215ENST00000502470 WDR97A6NE52 1622 aa48.18■■■■■ 5.3
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MIB2-215ENST00000502470 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.99■■■■■ 5.27
MIB2-215ENST00000502470 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.97■■■■■ 5.27
MIB2-215ENST00000502470 TOP2BQ02880 1626 aa47.95■■■■■ 5.27
MIB2-215ENST00000502470 SYNJ1O43426 1573 aa47.94■■■■■ 5.26
MIB2-215ENST00000502470 FBLN2P98095 1184 aa47.94■■■■■ 5.26
MIB2-215ENST00000502470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.93■■■■■ 5.26
MIB2-215ENST00000502470 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.92■■■■■ 5.26
MIB2-215ENST00000502470 PBRM1Q86U86 1689 aa47.92■■■■■ 5.26
MIB2-215ENST00000502470 GRIN2BQ13224 1484 aa47.91■■■■■ 5.26
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MIB2-215ENST00000502470 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.85■■■■■ 5.25
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MIB2-215ENST00000502470 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.84■■■■■ 5.25
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MIB2-215ENST00000502470 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.57■■■■■ 5.21
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MIB2-215ENST00000502470 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.34■■■■■ 5.17
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MIB2-215ENST00000502470 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.25■■■■■ 5.15
MIB2-215ENST00000502470 CEP170Q5SW79 1584 aa47.18■■■■■ 5.14
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MIB2-215ENST00000502470 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.92■■■■■ 5.1
MIB2-215ENST00000502470 SHROOM2Q13796 1616 aa46.91■■■■■ 5.1
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MIB2-215ENST00000502470 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.76■■■■■ 5.08
MIB2-215ENST00000502470 JPH4Q96JJ6 628 aa46.61■■■■■ 5.05
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