RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510793.5

MIB2-225, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 5

Gene MIB2, Length 889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-225ENST00000510793 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.18■■■■■ 6.42
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MIB2-225ENST00000510793 NACADO15069 1562 aa46.5■■■■■ 5.03
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MIB2-225ENST00000510793 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.96■■■■■ 4.95
MIB2-225ENST00000510793 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.87■■■■■ 4.93
MIB2-225ENST00000510793 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.85■■■■■ 4.93
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MIB2-225ENST00000510793 SCRIBQ14160 1630 aa45.07■■■■■ 4.81
MIB2-225ENST00000510793 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
MIB2-225ENST00000510793 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.28■■■■■ 4.68
MIB2-225ENST00000510793 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
MIB2-225ENST00000510793 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.02■■■■■ 4.64
MIB2-225ENST00000510793 SMARCA4P51532 1647 aa43■■■■■ 4.47
MIB2-225ENST00000510793 NCAPD3P42695 1498 aa42.91■■■■■ 4.46
MIB2-225ENST00000510793 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.88■■■■■ 4.46
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MIB2-225ENST00000510793 SMARCA2P51531 1590 aa42.76■■■■■ 4.44
MIB2-225ENST00000510793 HMGXB3Q12766 1538 aa42.67■■■■■ 4.42
MIB2-225ENST00000510793 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.57■■■■■ 4.41
MIB2-225ENST00000510793 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.53■■■■■ 4.4
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MIB2-225ENST00000510793 ERCC6Q03468 1493 aa42.19■■■■■ 4.34
MIB2-225ENST00000510793 WIZO95785 1651 aa42.12■■■■■ 4.33
MIB2-225ENST00000510793 CUX2O14529 1486 aa41.94■■■■■ 4.3
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MIB2-225ENST00000510793 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.63■■■■■ 4.25
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MIB2-225ENST00000510793 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.2■■■■■ 4.19
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MIB2-225ENST00000510793 WDR62O43379 1518 aa41.19■■■■■ 4.18
MIB2-225ENST00000510793 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.07■■■■■ 4.16
MIB2-225ENST00000510793 PRDM2Q13029 1718 aa41.01■■■■■ 4.16
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MIB2-225ENST00000510793 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.37■■■■■ 4.05
MIB2-225ENST00000510793 IFT140Q96RY7 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
MIB2-225ENST00000510793 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
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MIB2-225ENST00000510793 TRIM41Q8WV44 630 aa39.85■■■■□ 3.97
MIB2-225ENST00000510793 CHD1O14646 1710 aa39.8■■■■□ 3.96
MIB2-225ENST00000510793 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
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MIB2-225ENST00000510793 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
MIB2-225ENST00000510793 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.59■■■■□ 3.93
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MIB2-225ENST00000510793 TOP2BQ02880 1626 aa39.42■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.42■■■■□ 3.9
MIB2-225ENST00000510793 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
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MIB2-225ENST00000510793 ARAP1Q96P48 1450 aa39.18■■■■□ 3.86
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MIB2-225ENST00000510793 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.95■■■■□ 3.83
MIB2-225ENST00000510793 CEP170Q5SW79 1584 aa38.91■■■■□ 3.82
MIB2-225ENST00000510793 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.9■■■■□ 3.82
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MIB2-225ENST00000510793 SHROOM2Q13796 1616 aa38.69■■■■□ 3.78
MIB2-225ENST00000510793 KIF27Q86VH2 1401 aa38.59■■■■□ 3.77
MIB2-225ENST00000510793 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
MIB2-225ENST00000510793 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.54■■■■□ 3.76
MIB2-225ENST00000510793 IGF1RP08069 1367 aa38.54■■■■□ 3.76
MIB2-225ENST00000510793 CUL7Q14999 1698 aa38.51■■■■□ 3.76
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