RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534328.5

AP2A2-222, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit alpha 2, human

TSL 5 BASIC

Gene AP2A2, Length 1,491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP2A2-222	ENST00000534328	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.05	■■■■□ 3.84
AP2A2-222	ENST00000534328	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.05	■■■■□ 3.2
AP2A2-222	ENST00000534328	ABCC9	O60706	1549 aa		34.57	■■■■□ 3.13
AP2A2-222	ENST00000534328	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.2	■■■□□ 2.9
AP2A2-222	ENST00000534328	NACAD	O15069	1562 aa		33.03	■■■□□ 2.88
AP2A2-222	ENST00000534328	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.8	■■■□□ 2.84
AP2A2-222	ENST00000534328	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.67	■■■□□ 2.82
AP2A2-222	ENST00000534328	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
AP2A2-222	ENST00000534328	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.38	■■■□□ 2.77
AP2A2-222	ENST00000534328	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.35	■■■□□ 2.77
AP2A2-222	ENST00000534328	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.16	■■■□□ 2.74
AP2A2-222	ENST00000534328	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.06	■■■□□ 2.72
AP2A2-222	ENST00000534328	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.98	■■■□□ 2.71
AP2A2-222	ENST00000534328	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.88	■■■□□ 2.69
AP2A2-222	ENST00000534328	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.83	■■■□□ 2.69
AP2A2-222	ENST00000534328	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
AP2A2-222	ENST00000534328	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.3	■■■□□ 2.6
AP2A2-222	ENST00000534328	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.17	■■■□□ 2.58
AP2A2-222	ENST00000534328	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.43	■■■□□ 2.46
AP2A2-222	ENST00000534328	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.4	■■■□□ 2.46
AP2A2-222	ENST00000534328	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.38	■■■□□ 2.45
AP2A2-222	ENST00000534328	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.37	■■■□□ 2.45
AP2A2-222	ENST00000534328	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.33	■■■□□ 2.45
AP2A2-222	ENST00000534328	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.28	■■■□□ 2.44
AP2A2-222	ENST00000534328	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.15	■■■□□ 2.42
AP2A2-222	ENST00000534328	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
AP2A2-222	ENST00000534328	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.06	■■■□□ 2.4
AP2A2-222	ENST00000534328	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
AP2A2-222	ENST00000534328	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.96	■■■□□ 2.39
AP2A2-222	ENST00000534328	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
AP2A2-222	ENST00000534328	CUX2	O14529	1486 aa		29.8	■■■□□ 2.36
AP2A2-222	ENST00000534328	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.77	■■■□□ 2.36
AP2A2-222	ENST00000534328	WIZ	O95785	1651 aa		29.77	■■■□□ 2.36
AP2A2-222	ENST00000534328	NES	P48681	1621 aa		29.73	■■■□□ 2.35
AP2A2-222	ENST00000534328	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.57	■■■□□ 2.32
AP2A2-222	ENST00000534328	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.5	■■■□□ 2.31
AP2A2-222	ENST00000534328	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.49	■■■□□ 2.31
AP2A2-222	ENST00000534328	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
AP2A2-222	ENST00000534328	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.48	■■■□□ 2.31
AP2A2-222	ENST00000534328	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.32	■■■□□ 2.28
AP2A2-222	ENST00000534328	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.25	■■■□□ 2.27
AP2A2-222	ENST00000534328	CFTR	P13569	1480 aa		29.22	■■■□□ 2.27
AP2A2-222	ENST00000534328	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.22	■■■□□ 2.27
AP2A2-222	ENST00000534328	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.17	■■■□□ 2.26
AP2A2-222	ENST00000534328	WDR62	O43379	1518 aa		29.17	■■■□□ 2.26
AP2A2-222	ENST00000534328	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.16	■■■□□ 2.26
AP2A2-222	ENST00000534328	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.12	■■■□□ 2.25
AP2A2-222	ENST00000534328	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
AP2A2-222	ENST00000534328	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.73	■■■□□ 2.19
AP2A2-222	ENST00000534328	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AP2A2-222	ENST00000534328	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AP2A2-222	ENST00000534328	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AP2A2-222	ENST00000534328	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.46	■■■□□ 2.15
AP2A2-222	ENST00000534328	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.44	■■■□□ 2.14
AP2A2-222	ENST00000534328	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
AP2A2-222	ENST00000534328	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
AP2A2-222	ENST00000534328	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
AP2A2-222	ENST00000534328	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
AP2A2-222	ENST00000534328	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.25	■■■□□ 2.11
AP2A2-222	ENST00000534328	SOGA1	O94964	1423 aa		28.25	■■■□□ 2.11
AP2A2-222	ENST00000534328	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.25	■■■□□ 2.11	1e-6	■■■■■ 85.5
AP2A2-222	ENST00000534328	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.23	■■■□□ 2.11
AP2A2-222	ENST00000534328	CUX1	P39880	1505 aa		28.21	■■■□□ 2.11
AP2A2-222	ENST00000534328	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.21	■■■□□ 2.11	4e-7	■■■■□ 21.4
AP2A2-222	ENST00000534328	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.18	■■■□□ 2.1
AP2A2-222	ENST00000534328	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.17	■■■□□ 2.1
AP2A2-222	ENST00000534328	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.16	■■■□□ 2.1
AP2A2-222	ENST00000534328	CHD1	O14646	1710 aa		28.14	■■■□□ 2.1
AP2A2-222	ENST00000534328	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.12	■■■□□ 2.09
AP2A2-222	ENST00000534328	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.11	■■■□□ 2.09
AP2A2-222	ENST00000534328	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
AP2A2-222	ENST00000534328	FBLN2	P98095	1184 aa		28.04	■■■□□ 2.08
AP2A2-222	ENST00000534328	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.02	■■■□□ 2.08
AP2A2-222	ENST00000534328	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.02	■■■□□ 2.08
AP2A2-222	ENST00000534328	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.02	■■■□□ 2.08
AP2A2-222	ENST00000534328	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.01	■■■□□ 2.07
AP2A2-222	ENST00000534328	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
AP2A2-222	ENST00000534328	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.99	■■■□□ 2.07
AP2A2-222	ENST00000534328	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.97	■■■□□ 2.07
AP2A2-222	ENST00000534328	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.96	■■■□□ 2.07
AP2A2-222	ENST00000534328	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.95	■■■□□ 2.07
AP2A2-222	ENST00000534328	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.94	■■■□□ 2.06
AP2A2-222	ENST00000534328	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
AP2A2-222	ENST00000534328	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.89	■■■□□ 2.06
AP2A2-222	ENST00000534328	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.89	■■■□□ 2.05
AP2A2-222	ENST00000534328	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.77	■■■□□ 2.04
AP2A2-222	ENST00000534328	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.7	■■■□□ 2.02
AP2A2-222	ENST00000534328	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.68	■■■□□ 2.02
AP2A2-222	ENST00000534328	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.67	■■■□□ 2.02
AP2A2-222	ENST00000534328	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.66	■■■□□ 2.02
AP2A2-222	ENST00000534328	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.65	■■■□□ 2.02
AP2A2-222	ENST00000534328	EEA1	Q15075	1411 aa		27.63	■■■□□ 2.01
AP2A2-222	ENST00000534328	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.63	■■■□□ 2.01
AP2A2-222	ENST00000534328	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.6	■■■□□ 2.01
AP2A2-222	ENST00000534328	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.56	■■■□□ 2
AP2A2-222	ENST00000534328	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
AP2A2-222	ENST00000534328	NUP160	Q12769	1436 aa		27.5	■■□□□ 1.99
AP2A2-222	ENST00000534328	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		27.48	■■□□□ 1.99
AP2A2-222	ENST00000534328	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.47	■■□□□ 1.99
AP2A2-222	ENST00000534328	IGF1R	P08069	1367 aa		27.42	■■□□□ 1.98

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