Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 ZNF514-204ENST00000496060 5593 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.342e-9■■□□□ 12
HLTFQ14527 MRPS5-205ENST00000475040 713 ntTSL 210.22□□□□□ -0.772e-9■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.371e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.962e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.532e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZFYVE9-203ENST00000361625 2625 ntTSL 1 (best)4.82□□□□□ -1.641e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 519.77■□□□□ 0.767e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-218ENST00000529858 550 ntTSL 419.25■□□□□ 0.677e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.577e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 318.1■□□□□ 0.497e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-221ENST00000531548 554 ntTSL 416.94■□□□□ 0.37e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-210ENST00000527024 527 ntTSL 416.94■□□□□ 0.37e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.37e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-223ENST00000534485 556 ntTSL 416.72■□□□□ 0.277e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 215.3■□□□□ 0.047e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.017e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-203ENST00000524559 935 ntTSL 510.69□□□□□ -0.77e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-217ENST00000529818 549 ntTSL 410.33□□□□□ -0.767e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-219ENST00000530801 557 ntTSL 48.3□□□□□ -1.087e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 AP2A2-209ENST00000526753 464 ntTSL 44.04□□□□□ -1.767e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF638-205ENST00000417778 760 ntTSL 312.91□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF638-209ENST00000455226 585 ntTSL 411.71□□□□□ -0.533e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF638-207ENST00000454122 731 ntTSL 311.36□□□□□ -0.593e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF638-208ENST00000454278 595 ntTSL 411.2□□□□□ -0.623e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 ZNF638-220ENST00000487707 592 ntTSL 310.53□□□□□ -0.723e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.749e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.099e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.132e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.25e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.235e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.415e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 CPED1-207ENST00000466055 543 ntTSL 36.14□□□□□ -1.435e-7■■□□□ 12
HLTFQ14527 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.454e-11■■□□□ 12
HLTFQ14527 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.274e-11■■□□□ 12
HLTFQ14527 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-11■■□□□ 12
HLTFQ14527 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 511.93□□□□□ -0.54e-11■■□□□ 12
HLTFQ14527 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.027e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.037e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.257e-8■■□□□ 12
HLTFQ14527 ESCO1-202ENST00000383276 4773 ntTSL 213.21□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.771e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 PVR-201ENST00000187830 3132 ntTSL 215.86■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 12
HLTFQ14527 DST-225ENST00000522360 530 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-6■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.188e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.218e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.528e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.898e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-234ENST00000413358 916 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.968e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.998e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.28e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.328e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 524.51■■□□□ 1.512e-6■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.289e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.549e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 519.8■□□□□ 0.766e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.492e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.036e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 214.82□□□□□ -0.042e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SVIL-AS1-201ENST00000413405 767 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.216e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 MACF1-224ENST00000496804 5065 ntTSL 510.09□□□□□ -0.796e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 59.58□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 49.37□□□□□ -0.916e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 MACF1-216ENST00000476350 5304 ntTSL 29.2□□□□□ -0.946e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 MACF1-229ENST00000530262 6257 ntTSL 58.32□□□□□ -1.086e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.246e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 57.16□□□□□ -1.262e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SVIL-AS1-203ENST00000423223 507 ntTSL 25.9□□□□□ -1.466e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 33.55□□□□□ -1.846e-10■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 214.36□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.374e-6■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.77□□□□□ -0.534e-6■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.525e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.485e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 CHKA-203ENST00000525155 1201 ntTSL 512.06□□□□□ -0.485e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 CHKA-207ENST00000533728 662 ntTSL 210.28□□□□□ -0.765e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.613e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 511.07□□□□□ -0.643e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.93e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.923e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.043e-7■■□□□ 11.9
HLTFQ14527 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.043e-7■■□□□ 11.9
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