Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-215ENST00000532313 5239 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.262e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-202ENST00000361054 4115 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.273e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-203ENST00000458271 1324 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.335e-15■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-213ENST00000530120 568 ntTSL 412.64□□□□□ -0.392e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 MAGEB1-203ENST00000397550 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 MGRN1-215ENST00000591895 556 ntTSL 412.11□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-203ENST00000409167 1372 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-216ENST00000532460 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-201ENST00000337752 4767 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.534e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CRY2-204ENST00000488962 543 ntTSL 211.77□□□□□ -0.532e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-204ENST00000409322 797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-206ENST00000558157 2439 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.582e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-209ENST00000526723 574 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-208ENST00000526317 374 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-207ENST00000526256 582 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-219ENST00000561326 543 ntTSL 411.07□□□□□ -0.642e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-216ENST00000559873 584 ntTSL 510.76□□□□□ -0.692e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-204ENST00000471596 758 ntTSL 210.32□□□□□ -0.762e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-211ENST00000559257 2217 ntTSL 510.3□□□□□ -0.762e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-205ENST00000400794 4134 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.912e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 GNRH1-201ENST00000276414 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-208ENST00000558285 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-212ENST00000639612 1281 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 AGK-208ENST00000495028 567 ntTSL 48.74□□□□□ -1.012e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-215ENST00000639688 4344 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ISPD-203ENST00000479493 929 ntTSL 38.46□□□□□ -1.065e-15■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-208ENST00000555034 505 ntTSL 38.16□□□□□ -1.15e-15■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.114e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-210ENST00000559192 5499 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.112e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ZBTB20-205ENST00000463890 575 ntTSL 57.63□□□□□ -1.194e-9■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 AGK-204ENST00000473884 568 ntTSL 57.54□□□□□ -1.22e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-203ENST00000577474 862 ntTSL 47.45□□□□□ -1.225e-15■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 SCYL2-205ENST00000548871 429 ntTSL 37.08□□□□□ -1.282e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-205ENST00000553904 337 ntTSL 36.9□□□□□ -1.35e-15■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ZBTB20-220ENST00000492665 475 ntTSL 36.72□□□□□ -1.334e-9■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-203ENST00000585680 1792 ntTSL 56.56□□□□□ -1.362e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.675e-12■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.973e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.223e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-214ENST00000572576 754 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-213ENST00000572405 2337 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-210ENST00000572158 1521 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-223ENST00000576932 1252 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.763e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-203ENST00000536554 1522 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.023e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-209ENST00000571319 1524 ntTSL 28.7□□□□□ -1.023e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-207ENST00000570965 1026 ntTSL 54.63□□□□□ -1.673e-13■■■■■ 279.4
UTP3Q9NQZ2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 279.3
UTP3Q9NQZ2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 279
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 278.3
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 278.3
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-217ENST00000473348 491 ntTSL 513.51□□□□□ -0.253e-13■■■■■ 278.2
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 513.23□□□□□ -0.293e-13■■■■■ 278.2
UTP3Q9NQZ2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 278
UTP3Q9NQZ2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 277.8
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-206ENST00000564328 2323 ntTSL 521.5■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 277.5
UTP3Q9NQZ2 TKFC-216ENST00000532173 805 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 277.4
UTP3Q9NQZ2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 277.4
UTP3Q9NQZ2 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 525.71■■□□□ 1.718e-7■■■■■ 277.4
UTP3Q9NQZ2 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 277.4
UTP3Q9NQZ2 SLTM-206ENST00000480144 2277 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 212.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-220ENST00000559880 717 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 29.86□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-217ENST00000558756 896 ntTSL 57.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-215ENST00000558486 585 ntTSL 47.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-201ENST00000249736 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.79□□□□□ -1.162e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-219ENST00000559305 559 ntTSL 45.61□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 SLTM-224ENST00000560682 495 ntTSL 35.24□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 276.9
UTP3Q9NQZ2 MRPL16-203ENST00000531802 557 ntTSL 217.83■□□□□ 0.441e-47■■■■■ 276.7
UTP3Q9NQZ2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.271e-47■■■■■ 276.7
UTP3Q9NQZ2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 276.7
UTP3Q9NQZ2 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 276.7
UTP3Q9NQZ2 TRMU-204ENST00000441818 1793 ntTSL 1 (best)22.96■■□□□ 1.272e-9■■■■■ 276.6
UTP3Q9NQZ2 TRMU-207ENST00000457572 1882 ntTSL 222.36■■□□□ 1.172e-9■■■■■ 276.6
UTP3Q9NQZ2 TRMU-205ENST00000453630 1775 ntTSL 222.06■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 276.6
UTP3Q9NQZ2 TRMU-203ENST00000381021 1830 ntTSL 221.83■■□□□ 1.082e-9■■■■■ 276.6
UTP3Q9NQZ2 TRMU-206ENST00000456595 1688 ntTSL 1 (best)21.69■■□□□ 1.062e-9■■■■■ 276.6
UTP3Q9NQZ2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-9■■■■■ 276.6
UTP3Q9NQZ2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 276.6
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