RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HRCP23327 699 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC9O60706 1549 aa29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NACADO15069 1562 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCRIBQ14160 1630 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYT1Q01538 1121 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WIZO95785 1651 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMARCA4P51532 1647 aa27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEUROD1Q13562 356 aa27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.55■■■□□ 2
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMARCA2P51531 1590 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIM41Q8WV44 630 aa27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCAPD3P42695 1498 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HMGXB3Q12766 1538 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC8Q09428 1581 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC2L-201ENST00000301021 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CFTRP13569 1480 aa26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MIER1Q8N108 512 aa26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SYNJ1O43426 1573 aa26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCL11AQ9H165 835 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SOGA1O94964 1423 aa26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRDM2Q13029 1718 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOP2BQ02880 1626 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP162Q5TB80 1403 aa26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CUX1P39880 1505 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NESP48681 1621 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EEA1Q15075 1411 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.91■■□□□ 1.74
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.87■■□□□ 1.73
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA3Q08378 1498 aa25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOPBP1Q92547 1522 aa25.85■■□□□ 1.73
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF21BO75037 1637 aa25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF27Q86VH2 1401 aa25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC2L-201ENST00000301021 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CUX2O14529 1486 aa25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRXQ9BXM0 1461 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IGF1RP08069 1367 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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