Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 EIF3I-204ENST00000474371 643 ntTSL 38.8□□□□□ -12e-6■■■□□ 15.3
G3BP1Q13283 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-7■■■□□ 15.3
G3BP1Q13283 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-7■■■□□ 15.3
G3BP1Q13283 TPM3-216ENST00000473036 746 ntTSL 216.25■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 15.3
G3BP1Q13283 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 412.37□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 15.3
G3BP1Q13283 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 418.23■□□□□ 0.512e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ATP5A1-214ENST00000590448 604 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 513.07□□□□□ -0.322e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 520.75■□□□□ 0.912e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 519.75■□□□□ 0.752e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 519.54■□□□□ 0.722e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.423e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.313e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.093e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.653e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.873e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 216.32■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDOC-206ENST00000578590 839 ntTSL 413.44□□□□□ -0.263e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPU-225ENST00000640119 461 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-12■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CCT3-208ENST00000415548 513 ntTSL 310.39□□□□□ -0.758e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.113e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RNF40-211ENST00000567365 597 ntTSL 315.38■□□□□ 0.053e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HNRNPF-205ENST00000477108 636 ntTSL 1 (best)19.14■□□□□ 0.653e-11■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PSMD11-203ENST00000469475 473 ntTSL 217.84■□□□□ 0.455e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PSMD11-211ENST00000585265 670 ntTSL 214.76□□□□□ -0.055e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 FDFT1-219ENST00000531249 768 ntTSL 216.9■□□□□ 0.31e-13■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 510.12□□□□□ -0.799e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PRDX2-204ENST00000477555 699 ntTSL 213.66□□□□□ -0.229e-8■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PHB-206ENST00000504124 796 ntTSL 515.66■□□□□ 0.11e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PHB-203ENST00000419140 907 ntTSL 511.55□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 320.65■□□□□ 0.91e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 EIF4G1-221ENST00000441154 4311 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.357e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 515.02■□□□□ -07e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 25.72□□□□□ -1.494e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.31e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.281e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.091e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 VARS2-204ENST00000467717 863 ntTSL 321.18■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 VARS2-203ENST00000428017 1103 ntTSL 218.8■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 VARS2-210ENST00000490699 719 ntTSL 313.57□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 EIF4A1-234ENST00000584798 1440 nt10.66□□□□□ -0.73e-19■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 USP11-206ENST00000469080 3467 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 223.25■■□□□ 1.313e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.62e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.132e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 227.15■■□□□ 1.942e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PRMT5-222ENST00000556426 563 ntTSL 324.73■■□□□ 1.552e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH16A1-206ENST00000598015 287 ntTSL 323.83■■□□□ 1.412e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.382e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.982e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.972e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-212ENST00000563038 2692 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 218.55■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ALDH16A1-207ENST00000599652 3995 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 216.61■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 216.24■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.014e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.012e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 UBE2O-206ENST00000590658 567 ntTSL 414.25□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 PCK2-210ENST00000559584 666 ntTSL 512.31□□□□□ -0.448e-23■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MAOA-201ENST00000338702 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 SMARCB1-206ENST00000477836 660 ntTSL 211.73□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MAOA-203ENST00000497485 935 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.722e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 310.05□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 ANXA5-205ENST00000509648 1083 ntTSL 24.85□□□□□ -1.635e-9■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.321e-7■■■□□ 15.2
G3BP1Q13283 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.141e-7■■■□□ 15.2
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