Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 511.09□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 58.7□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 516.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 39.2
SF3B1O75533 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 AC069277.1-204ENST00000342990 246 ntTSL 38.69□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 39.1
SF3B1O75533 GPR75-ASB3-202ENST00000459916 556 ntTSL 425.93■■□□□ 1.745e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 GPR75-ASB3-203ENST00000498475 736 ntTSL 525.93■■□□□ 1.745e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PRKRA-202ENST00000424699 1616 ntTSL 223.22■■□□□ 1.315e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.085e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SEPSECS-205ENST00000513285 561 ntTSL 421.11■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SEPSECS-206ENST00000514585 1494 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 CDKN1B-203ENST00000442489 577 ntTSL 518.12■□□□□ 0.495e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PLOD1-203ENST00000429000 886 ntTSL 517.38■□□□□ 0.375e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 STK11-206ENST00000586358 770 ntTSL 516.36■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PLOD1-202ENST00000358133 819 ntTSL 315.44■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 VDAC1-207ENST00000492324 635 ntTSL 215.33■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 315.07■□□□□ 05e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 314.9□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 VDAC1-206ENST00000489906 694 ntTSL 213.98□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ADGRL1-206ENST00000591528 612 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 513.73□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PRKRA-210ENST00000474793 796 ntTSL 313.45□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 LONP1-209ENST00000590206 725 ntTSL 313.42□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-208ENST00000465245 634 ntTSL 313.4□□□□□ -0.265e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-212ENST00000480461 538 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 213.13□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ZEB2-233ENST00000636179 8984 ntTSL 512.51□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SEPSECS-201ENST00000358971 3344 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 IFITM3-203ENST00000531688 500 ntTSL 311.54□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 YY1AP1-216ENST00000442834 2508 ntTSL 211.2□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 KIF5A-202ENST00000455537 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 HNRNPC-220ENST00000555585 682 ntTSL 210.21□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SMG6-218ENST00000575454 652 ntTSL 310.03□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 59.21□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 COPB2-206ENST00000510181 1037 ntTSL 28.31□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 HNRNPC-210ENST00000554417 691 ntTSL 27.88□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 DENND4C-201ENST00000361024 3463 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.255e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 DENND4C-203ENST00000380427 3479 ntTSL 27.03□□□□□ -1.285e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PRKRA-212ENST00000490501 1851 ntTSL 26.88□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 COPB2-213ENST00000515006 548 ntTSL 56.31□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.415e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 CDKN1B-204ENST00000477087 453 ntTSL 35.98□□□□□ -1.455e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 DENND4C-202ENST00000380424 1547 ntTSL 24.61□□□□□ -1.675e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PTPN12-208ENST00000447995 572 ntTSL 34.18□□□□□ -1.745e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 SMG6-208ENST00000570874 533 ntTSL 43.39□□□□□ -1.875e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 TRA2B-210ENST00000471134 724 ntTSL 52.93□□□□□ -1.945e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PTPN12-210ENST00000464313 551 ntTSL 42.83□□□□□ -1.965e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PTPN12-215ENST00000522115 642 ntTSL 52.36□□□□□ -2.035e-6■■■■■ 39
SF3B1O75533 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.136e-7■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 TMEM131L-204ENST00000445960 538 ntTSL 419.28■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 MAP4-203ENST00000383736 2282 ntTSL 56.94□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 TBL1XR1-231ENST00000637137 107 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 413.59□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 38.9
SF3B1O75533 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.629e-7■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.569e-7■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.36□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 315.97■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.942e-10■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 DMTF1-230ENST00000580710 635 ntTSL 527.05■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 38.8
SF3B1O75533 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.73e-6■■■■■ 38.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3656 ms