RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325748.8

PRKRA-201, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKRA, Length 1,826 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRA-201ENST00000325748 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.62■■■■■ 5.21
PRKRA-201ENST00000325748 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.68■■■■■ 4.26
PRKRA-201ENST00000325748 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
PRKRA-201ENST00000325748 ABCC9O60706 1549 aa39.82■■■■□ 3.96
PRKRA-201ENST00000325748 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.47■■■■□ 3.91
PRKRA-201ENST00000325748 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.32■■■■□ 3.89
PRKRA-201ENST00000325748 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.98■■■■□ 3.83
PRKRA-201ENST00000325748 NACADO15069 1562 aa38.89■■■■□ 3.82
PRKRA-201ENST00000325748 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.67■■■■□ 3.78
PRKRA-201ENST00000325748 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.64■■■■□ 3.78
PRKRA-201ENST00000325748 SCRIBQ14160 1630 aa38.34■■■■□ 3.73
PRKRA-201ENST00000325748 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.95■■■■□ 3.67
PRKRA-201ENST00000325748 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.56■■■■□ 3.6
PRKRA-201ENST00000325748 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.59
PRKRA-201ENST00000325748 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.07■■■■□ 3.53
PRKRA-201ENST00000325748 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
PRKRA-201ENST00000325748 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.81■■■■□ 3.48
PRKRA-201ENST00000325748 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
PRKRA-201ENST00000325748 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
PRKRA-201ENST00000325748 SMARCA4P51532 1647 aa36.7■■■■□ 3.47
PRKRA-201ENST00000325748 WIZO95785 1651 aa36.5■■■■□ 3.43
PRKRA-201ENST00000325748 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
PRKRA-201ENST00000325748 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.24■■■■□ 3.39
PRKRA-201ENST00000325748 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.17■■■■□ 3.38
PRKRA-201ENST00000325748 SMARCA2P51531 1590 aa36.12■■■■□ 3.37
PRKRA-201ENST00000325748 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PRKRA-201ENST00000325748 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.01■■■■□ 3.36
PRKRA-201ENST00000325748 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PRKRA-201ENST00000325748 NCAPD3P42695 1498 aa35.91■■■■□ 3.34
PRKRA-201ENST00000325748 HMGXB3Q12766 1538 aa35.83■■■■□ 3.33
PRKRA-201ENST00000325748 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.71■■■■□ 3.31
PRKRA-201ENST00000325748 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.48■■■■□ 3.27
PRKRA-201ENST00000325748 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.16■■■■□ 3.22
PRKRA-201ENST00000325748 CFTRP13569 1480 aa35.02■■■■□ 3.2
PRKRA-201ENST00000325748 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.96■■■■□ 3.19
PRKRA-201ENST00000325748 ABCC8Q09428 1581 aa34.88■■■■□ 3.17
PRKRA-201ENST00000325748 NESP48681 1621 aa34.86■■■■□ 3.17
PRKRA-201ENST00000325748 PRDM2Q13029 1718 aa34.83■■■■□ 3.17
PRKRA-201ENST00000325748 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.75■■■■□ 3.15
PRKRA-201ENST00000325748 TRIM41Q8WV44 630 aa34.74■■■■□ 3.15
PRKRA-201ENST00000325748 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.64■■■■□ 3.14
PRKRA-201ENST00000325748 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.6■■■■□ 3.13
PRKRA-201ENST00000325748 SYNJ1O43426 1573 aa34.56■■■■□ 3.12
PRKRA-201ENST00000325748 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.47■■■■□ 3.11
PRKRA-201ENST00000325748 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.43■■■■□ 3.1
PRKRA-201ENST00000325748 CUX1P39880 1505 aa34.43■■■■□ 3.1
PRKRA-201ENST00000325748 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.41■■■■□ 3.1
PRKRA-201ENST00000325748 TOP2BQ02880 1626 aa34.41■■■■□ 3.1
PRKRA-201ENST00000325748 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.39■■■■□ 3.1
PRKRA-201ENST00000325748 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.22■■■■□ 3.07
PRKRA-201ENST00000325748 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PRKRA-201ENST00000325748 TOPBP1Q92547 1522 aa34.19■■■■□ 3.06
PRKRA-201ENST00000325748 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
PRKRA-201ENST00000325748 ERCC6Q03468 1493 aa34.14■■■■□ 3.06
PRKRA-201ENST00000325748 SOGA1O94964 1423 aa34.12■■■■□ 3.05
PRKRA-201ENST00000325748 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.11■■■■□ 3.05
PRKRA-201ENST00000325748 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.08■■■■□ 3.05
PRKRA-201ENST00000325748 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.05■■■■□ 3.04
PRKRA-201ENST00000325748 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PRKRA-201ENST00000325748 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
PRKRA-201ENST00000325748 WDR62O43379 1518 aa33.93■■■■□ 3.02
PRKRA-201ENST00000325748 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.91■■■■□ 3.02
PRKRA-201ENST00000325748 EEA1Q15075 1411 aa33.87■■■■□ 3.01
PRKRA-201ENST00000325748 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.83■■■■□ 3.01
PRKRA-201ENST00000325748 CUX2O14529 1486 aa33.81■■■■□ 3
PRKRA-201ENST00000325748 KIF27Q86VH2 1401 aa33.77■■■■□ 3
PRKRA-201ENST00000325748 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.77■■■■□ 3
PRKRA-201ENST00000325748 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.77■■■■□ 3
PRKRA-201ENST00000325748 WDR97A6NE52 1622 aa33.74■■■□□ 2.99
PRKRA-201ENST00000325748 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.73■■■□□ 2.99
PRKRA-201ENST00000325748 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
PRKRA-201ENST00000325748 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PRKRA-201ENST00000325748 IFT140Q96RY7 1462 aa33.59■■■□□ 2.97
PRKRA-201ENST00000325748 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.56■■■□□ 2.96
PRKRA-201ENST00000325748 IGF1RP08069 1367 aa33.53■■■□□ 2.96
PRKRA-201ENST00000325748 KIF21BO75037 1637 aa33.51■■■□□ 2.96
PRKRA-201ENST00000325748 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PRKRA-201ENST00000325748 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.49■■■□□ 2.95
PRKRA-201ENST00000325748 PRXQ9BXM0 1461 aa33.47■■■□□ 2.95
PRKRA-201ENST00000325748 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.46■■■□□ 2.953e-6■■■■□ 24.7
PRKRA-201ENST00000325748 GOLGA3Q08378 1498 aa33.44■■■□□ 2.94
PRKRA-201ENST00000325748 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.44■■■□□ 2.94
PRKRA-201ENST00000325748 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.36■■■□□ 2.93
PRKRA-201ENST00000325748 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
PRKRA-201ENST00000325748 PBRM1Q86U86 1689 aa33.36■■■□□ 2.93
PRKRA-201ENST00000325748 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.35■■■□□ 2.93
PRKRA-201ENST00000325748 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
PRKRA-201ENST00000325748 CUL7Q14999 1698 aa33.31■■■□□ 2.92
PRKRA-201ENST00000325748 GRIN2BQ13224 1484 aa33.27■■■□□ 2.92
PRKRA-201ENST00000325748 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.25■■■□□ 2.91
PRKRA-201ENST00000325748 ADAMTS12P58397 1594 aa33.15■■■□□ 2.9
PRKRA-201ENST00000325748 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.13■■■□□ 2.89
PRKRA-201ENST00000325748 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.1■■■□□ 2.89
PRKRA-201ENST00000325748 CEP162Q5TB80 1403 aa33.08■■■□□ 2.89
PRKRA-201ENST00000325748 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
PRKRA-201ENST00000325748 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
PRKRA-201ENST00000325748 SYNJ2O15056 1496 aa32.92■■■□□ 2.86
PRKRA-201ENST00000325748 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.91■■■□□ 2.86
PRKRA-201ENST00000325748 CLIP1P30622 1438 aa32.9■■■□□ 2.86
PRKRA-201ENST00000325748 GRIN2AQ12879 1464 aa32.89■■■□□ 2.86
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