RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296425.9

PGRMC2-201, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 2,767 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-201ENST00000296425 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.47■■■■■ 5.19
PGRMC2-201ENST00000296425 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.17■■■■■ 4.18
PGRMC2-201ENST00000296425 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
PGRMC2-201ENST00000296425 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.27■■■■□ 3.88
PGRMC2-201ENST00000296425 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.13■■■■□ 3.85
PGRMC2-201ENST00000296425 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.98■■■■□ 3.83
PGRMC2-201ENST00000296425 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.68■■■■□ 3.78
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC9O60706 1549 aa38.64■■■■□ 3.78
PGRMC2-201ENST00000296425 NACADO15069 1562 aa38.31■■■■□ 3.72
PGRMC2-201ENST00000296425 SCRIBQ14160 1630 aa37.92■■■■□ 3.66
PGRMC2-201ENST00000296425 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.88■■■■□ 3.65
PGRMC2-201ENST00000296425 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
PGRMC2-201ENST00000296425 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.04■■■■□ 3.52
PGRMC2-201ENST00000296425 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
PGRMC2-201ENST00000296425 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.85■■■■□ 3.49
PGRMC2-201ENST00000296425 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.71■■■■□ 3.47
PGRMC2-201ENST00000296425 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.67■■■■□ 3.46
PGRMC2-201ENST00000296425 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
PGRMC2-201ENST00000296425 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
PGRMC2-201ENST00000296425 SMARCA4P51532 1647 aa36.39■■■■□ 3.42
PGRMC2-201ENST00000296425 WIZO95785 1651 aa36.37■■■■□ 3.41
PGRMC2-201ENST00000296425 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.32■■■■□ 3.4
PGRMC2-201ENST00000296425 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
PGRMC2-201ENST00000296425 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.95■■■■□ 3.35
PGRMC2-201ENST00000296425 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.73■■■■□ 3.31
PGRMC2-201ENST00000296425 SMARCA2P51531 1590 aa35.73■■■■□ 3.31
PGRMC2-201ENST00000296425 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.69■■■■□ 3.3
PGRMC2-201ENST00000296425 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PGRMC2-201ENST00000296425 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PGRMC2-201ENST00000296425 TRIM41Q8WV44 630 aa35.47■■■■□ 3.27
PGRMC2-201ENST00000296425 NCAPD3P42695 1498 aa35.38■■■■□ 3.25
PGRMC2-201ENST00000296425 HMGXB3Q12766 1538 aa35.34■■■■□ 3.25
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCC8Q09428 1581 aa35.02■■■■□ 3.2
PGRMC2-201ENST00000296425 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.96■■■■□ 3.19
PGRMC2-201ENST00000296425 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.93■■■■□ 3.18
PGRMC2-201ENST00000296425 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.82■■■■□ 3.16
PGRMC2-201ENST00000296425 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
PGRMC2-201ENST00000296425 CFTRP13569 1480 aa34.7■■■■□ 3.15
PGRMC2-201ENST00000296425 SYNJ1O43426 1573 aa34.59■■■■□ 3.13
PGRMC2-201ENST00000296425 EEA1Q15075 1411 aa34.54■■■■□ 3.12
PGRMC2-201ENST00000296425 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.51■■■■□ 3.12
PGRMC2-201ENST00000296425 SOGA1O94964 1423 aa34.48■■■■□ 3.11
PGRMC2-201ENST00000296425 TOP2BQ02880 1626 aa34.45■■■■□ 3.11
PGRMC2-201ENST00000296425 PRDM2Q13029 1718 aa34.43■■■■□ 3.1
PGRMC2-201ENST00000296425 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.38■■■■□ 3.09
PGRMC2-201ENST00000296425 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.32■■■■□ 3.08
PGRMC2-201ENST00000296425 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.3■■■■□ 3.08
PGRMC2-201ENST00000296425 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.27■■■■□ 3.08
PGRMC2-201ENST00000296425 CUX1P39880 1505 aa34.27■■■■□ 3.08
PGRMC2-201ENST00000296425 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.11■■■■□ 3.05
PGRMC2-201ENST00000296425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.09■■■■□ 3.05
PGRMC2-201ENST00000296425 GOLGA3Q08378 1498 aa34.04■■■■□ 3.04
PGRMC2-201ENST00000296425 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.04■■■■□ 3.04
PGRMC2-201ENST00000296425 NESP48681 1621 aa34.03■■■■□ 3.04
PGRMC2-201ENST00000296425 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.02■■■■□ 3.04
PGRMC2-201ENST00000296425 KIF21BO75037 1637 aa34.01■■■■□ 3.03
PGRMC2-201ENST00000296425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.98■■■■□ 3.03
PGRMC2-201ENST00000296425 KIF27Q86VH2 1401 aa33.92■■■■□ 3.02
PGRMC2-201ENST00000296425 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
PGRMC2-201ENST00000296425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.86■■■■□ 3.01
PGRMC2-201ENST00000296425 CEP162Q5TB80 1403 aa33.86■■■■□ 3.01
PGRMC2-201ENST00000296425 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.85■■■■□ 3.01
PGRMC2-201ENST00000296425 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.85■■■■□ 3.01
PGRMC2-201ENST00000296425 TOPBP1Q92547 1522 aa33.77■■■■□ 3
PGRMC2-201ENST00000296425 PRXQ9BXM0 1461 aa33.77■■■■□ 3
PGRMC2-201ENST00000296425 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.76■■■■□ 3
PGRMC2-201ENST00000296425 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.74■■■□□ 2.99
PGRMC2-201ENST00000296425 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.74■■■□□ 2.99
PGRMC2-201ENST00000296425 CUX2O14529 1486 aa33.71■■■□□ 2.99
PGRMC2-201ENST00000296425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.68■■■□□ 2.98
PGRMC2-201ENST00000296425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
PGRMC2-201ENST00000296425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.58■■■□□ 2.97
PGRMC2-201ENST00000296425 IGF1RP08069 1367 aa33.57■■■□□ 2.96
PGRMC2-201ENST00000296425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.57■■■□□ 2.96
PGRMC2-201ENST00000296425 CLIP1P30622 1438 aa33.52■■■□□ 2.96
PGRMC2-201ENST00000296425 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.52■■■□□ 2.96
PGRMC2-201ENST00000296425 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.41■■■□□ 2.94
PGRMC2-201ENST00000296425 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.37■■■□□ 2.93
PGRMC2-201ENST00000296425 WDR97A6NE52 1622 aa33.35■■■□□ 2.93
PGRMC2-201ENST00000296425 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.28■■■□□ 2.92
PGRMC2-201ENST00000296425 CUL7Q14999 1698 aa33.23■■■□□ 2.91
PGRMC2-201ENST00000296425 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
PGRMC2-201ENST00000296425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.23■■■□□ 2.91
PGRMC2-201ENST00000296425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
PGRMC2-201ENST00000296425 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
PGRMC2-201ENST00000296425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
PGRMC2-201ENST00000296425 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.19■■■□□ 2.9
PGRMC2-201ENST00000296425 WDR62O43379 1518 aa33.16■■■□□ 2.9
PGRMC2-201ENST00000296425 ERCC6Q03468 1493 aa33.12■■■□□ 2.89
PGRMC2-201ENST00000296425 ARAP1Q96P48 1450 aa33.11■■■□□ 2.89
PGRMC2-201ENST00000296425 HRCP23327 699 aa33.08■■■□□ 2.89
PGRMC2-201ENST00000296425 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.05■■■□□ 2.88
PGRMC2-201ENST00000296425 IFT140Q96RY7 1462 aa33.04■■■□□ 2.88
PGRMC2-201ENST00000296425 APLP2Q06481 763 aa33.02■■■□□ 2.88
PGRMC2-201ENST00000296425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
PGRMC2-201ENST00000296425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.91■■■□□ 2.864e-7■■■■□ 26.1
PGRMC2-201ENST00000296425 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
PGRMC2-201ENST00000296425 PBRM1Q86U86 1689 aa32.89■■■□□ 2.86
PGRMC2-201ENST00000296425 GRIN2BQ13224 1484 aa32.88■■■□□ 2.85
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