RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613358.4

PGRMC2-208, Transcript of progesterone receptor membrane component 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGRMC2, Length 3,783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC2-208ENST00000613358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.77■■■□□ 2.84
PGRMC2-208ENST00000613358 HRCP23327 699 aa29.85■■■□□ 2.37
PGRMC2-208ENST00000613358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
PGRMC2-208ENST00000613358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.54■■■□□ 2.32
PGRMC2-208ENST00000613358 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.5■■■□□ 2.31
PGRMC2-208ENST00000613358 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PGRMC2-208ENST00000613358 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PGRMC2-208ENST00000613358 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.83■■■□□ 2.21
PGRMC2-208ENST00000613358 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.77■■■□□ 2.2
PGRMC2-208ENST00000613358 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.75■■■□□ 2.19
PGRMC2-208ENST00000613358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PGRMC2-208ENST00000613358 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.35■■■□□ 2.13
PGRMC2-208ENST00000613358 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PGRMC2-208ENST00000613358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.07■■■□□ 2.08
PGRMC2-208ENST00000613358 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PGRMC2-208ENST00000613358 MYT1Q01538 1121 aa27.88■■■□□ 2.05
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.74■■■□□ 2.03
PGRMC2-208ENST00000613358 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PGRMC2-208ENST00000613358 NEUROD1Q13562 356 aa27.63■■■□□ 2.01
PGRMC2-208ENST00000613358 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.62■■■□□ 2.01
PGRMC2-208ENST00000613358 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.59■■■□□ 2.01
PGRMC2-208ENST00000613358 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
PGRMC2-208ENST00000613358 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PGRMC2-208ENST00000613358 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PGRMC2-208ENST00000613358 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PGRMC2-208ENST00000613358 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PGRMC2-208ENST00000613358 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PGRMC2-208ENST00000613358 TRIM41Q8WV44 630 aa27.18■■□□□ 1.94
PGRMC2-208ENST00000613358 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PGRMC2-208ENST00000613358 ABCC9O60706 1549 aa27.12■■□□□ 1.93
PGRMC2-208ENST00000613358 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PGRMC2-208ENST00000613358 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PGRMC2-208ENST00000613358 MIER1Q8N108 512 aa26.49■■□□□ 1.83
PGRMC2-208ENST00000613358 SCRIBQ14160 1630 aa26.46■■□□□ 1.83
PGRMC2-208ENST00000613358 BCL11AQ9H165 835 aa26.25■■□□□ 1.79
PGRMC2-208ENST00000613358 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PGRMC2-208ENST00000613358 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.15■■□□□ 1.78
PGRMC2-208ENST00000613358 NACADO15069 1562 aa26.13■■□□□ 1.77
PGRMC2-208ENST00000613358 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PGRMC2-208ENST00000613358 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
PGRMC2-208ENST00000613358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.1■■□□□ 1.77
PGRMC2-208ENST00000613358 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PGRMC2-208ENST00000613358 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.99■■□□□ 1.75
PGRMC2-208ENST00000613358 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.94■■□□□ 1.74
PGRMC2-208ENST00000613358 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PGRMC2-208ENST00000613358 BCANQ96GW7 911 aa25.92■■□□□ 1.74
PGRMC2-208ENST00000613358 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.8■■□□□ 1.72
PGRMC2-208ENST00000613358 CEP162Q5TB80 1403 aa25.77■■□□□ 1.72
PGRMC2-208ENST00000613358 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.76■■□□□ 1.71
PGRMC2-208ENST00000613358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
PGRMC2-208ENST00000613358 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PGRMC2-208ENST00000613358 APLP2Q06481 763 aa25.61■■□□□ 1.69
PGRMC2-208ENST00000613358 FKBP8Q14318 412 aa25.58■■□□□ 1.69
PGRMC2-208ENST00000613358 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.5■■□□□ 1.67
PGRMC2-208ENST00000613358 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.48■■□□□ 1.67
PGRMC2-208ENST00000613358 NEFLP07196 543 aa25.47■■□□□ 1.67
PGRMC2-208ENST00000613358 KCNH8Q96L42 1107 aa25.45■■□□□ 1.66
PGRMC2-208ENST00000613358 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PGRMC2-208ENST00000613358 ITGAEP38570 1179 aa25.43■■□□□ 1.66
PGRMC2-208ENST00000613358 SOGA1O94964 1423 aa25.42■■□□□ 1.66
PGRMC2-208ENST00000613358 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.42■■□□□ 1.66
PGRMC2-208ENST00000613358 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.4■■□□□ 1.66
PGRMC2-208ENST00000613358 ABCC8Q09428 1581 aa25.34■■□□□ 1.65
PGRMC2-208ENST00000613358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PGRMC2-208ENST00000613358 WIZO95785 1651 aa25.25■■□□□ 1.63
PGRMC2-208ENST00000613358 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.21■■□□□ 1.63
PGRMC2-208ENST00000613358 TRIM52Q96A61 297 aa25.19■■□□□ 1.62
PGRMC2-208ENST00000613358 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PGRMC2-208ENST00000613358 GOLGA3Q08378 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
PGRMC2-208ENST00000613358 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PGRMC2-208ENST00000613358 MSH5O43196 834 aa25.12■■□□□ 1.61
PGRMC2-208ENST00000613358 CLIP1P30622 1438 aa25.11■■□□□ 1.61
PGRMC2-208ENST00000613358 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PGRMC2-208ENST00000613358 EEA1Q15075 1411 aa25.03■■□□□ 1.6
PGRMC2-208ENST00000613358 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PGRMC2-208ENST00000613358 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PGRMC2-208ENST00000613358 SMARCA4P51532 1647 aa24.98■■□□□ 1.59
PGRMC2-208ENST00000613358 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PGRMC2-208ENST00000613358 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.96■■□□□ 1.59
PGRMC2-208ENST00000613358 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PGRMC2-208ENST00000613358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.89■■□□□ 1.58
PGRMC2-208ENST00000613358 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PGRMC2-208ENST00000613358 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.88■■□□□ 1.57
PGRMC2-208ENST00000613358 ANP32CO43423 234 aa24.88■■□□□ 1.57
PGRMC2-208ENST00000613358 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.84■■□□□ 1.57
PGRMC2-208ENST00000613358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PGRMC2-208ENST00000613358 NBR1Q14596 966 aa24.82■■□□□ 1.56
PGRMC2-208ENST00000613358 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PGRMC2-208ENST00000613358 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PGRMC2-208ENST00000613358 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.79■■□□□ 1.56
PGRMC2-208ENST00000613358 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
PGRMC2-208ENST00000613358 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.73■■□□□ 1.55
PGRMC2-208ENST00000613358 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.71■■□□□ 1.55
PGRMC2-208ENST00000613358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.7■■□□□ 1.54
PGRMC2-208ENST00000613358 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PGRMC2-208ENST00000613358 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.65■■□□□ 1.54
PGRMC2-208ENST00000613358 CCER2I3L3R5 266 aa24.62■■□□□ 1.53
PGRMC2-208ENST00000613358 SMARCA2P51531 1590 aa24.62■■□□□ 1.53
PGRMC2-208ENST00000613358 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PGRMC2-208ENST00000613358 KIF21BO75037 1637 aa24.58■■□□□ 1.53
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