Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 319.8■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 317.59■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 317.42■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 413.96□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 33.7
GTF2F1P35269 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.531e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.051e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 PUDP-205ENST00000498474 1040 ntTSL 48.97□□□□□ -0.971e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 PUDP-204ENST00000486446 586 ntTSL 28.12□□□□□ -1.111e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.888e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 412.39□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TBC1D22A-204ENST00000394449 2048 ntTSL 524.25■■□□□ 1.475e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.45e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.375e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TBC1D22A-207ENST00000441162 2636 ntTSL 216.28■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 CLEC16A-201ENST00000261657 4351 ntTSL 411.6□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TRIO-204ENST00000502816 736 ntTSL 227.45■■□□□ 1.987e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 TRIO-207ENST00000505971 605 ntTSL 323.07■■□□□ 1.287e-12■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 33.6
GTF2F1P35269 CTTN-204ENST00000393747 1315 ntTSL 520.29■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 217.93■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CTTN-210ENST00000525852 1470 ntTSL 513.42□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 312.15□□□□□ -0.467e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 38.96□□□□□ -0.989e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 FBXO31-208ENST00000636077 660 ntTSL 524.11■■□□□ 1.453e-10■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 RPH3AL-205ENST00000570893 594 ntTSL 317.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 HNF1A-207ENST00000540108 3039 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.584e-12■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.554e-12■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.234e-12■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.12■□□□□ 0.174e-12■■■■■ 33.5
GTF2F1P35269 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.427e-8■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.527e-8■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.527e-8■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.537e-8■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.687e-8■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.323e-9■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.124e-17■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.13e-9■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 220.24■□□□□ 0.834e-17■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 CMIP-204ENST00000561605 407 ntTSL 511.03□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 33.4
GTF2F1P35269 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 411.5□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.299e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 HPCAL1-203ENST00000419810 4781 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 224.32■■□□□ 1.482e-15■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.372e-11■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.576e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 522.24■■□□□ 1.156e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.162e-16■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.22e-16■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.32e-16■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-16■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 SLC8B1-214ENST00000552565 2287 ntTSL 218.86■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 227.18■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 33.3
GTF2F1P35269 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 ATAD3B-203ENST00000472194 4314 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 ATAD3B-202ENST00000378736 414 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.52e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 523.33■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 CNOT6-206ENST00000510148 456 ntTSL 428.09■■■□□ 2.094e-9■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 CNOT6-205ENST00000507016 382 ntTSL 326.18■■□□□ 1.784e-9■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.14e-9■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.754e-9■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 PLCXD1-207ENST00000443019 284 ntTSL 515.8■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 TGIF2-206ENST00000560025 923 ntTSL 319.95■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 TGIF2-204ENST00000558028 638 ntTSL 216.34■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 33.2
GTF2F1P35269 TANGO2-222ENST00000479679 894 ntTSL 226.21■■□□□ 1.792e-12■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 MRPL28-204ENST00000441883 800 ntTSL 530.36■■■□□ 2.455e-13■■■■■ 33.1
GTF2F1P35269 MRPL28-205ENST00000447696 722 ntTSL 326.5■■□□□ 1.835e-13■■■■■ 33.1
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 93.6 ms