Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3KQ9Y2Y1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3KQ9Y2Y1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3KQ9Y2Y1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR3KQ9Y2Y1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3KQ9Y2Y1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
POLR3KQ9Y2Y1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR3KQ9Y2Y1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms