Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H3

IFT80, Intraflagellar transport protein 80 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT80Q9P2H3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFT80Q9P2H3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFT80Q9P2H3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT80Q9P2H3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFT80Q9P2H3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFT80Q9P2H3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFT80Q9P2H3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFT80Q9P2H3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFT80Q9P2H3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFT80Q9P2H3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT80Q9P2H3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT80Q9P2H3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT80Q9P2H3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms