Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNAJC28Q9NX36 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAJC28Q9NX36 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAJC28Q9NX36 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAJC28Q9NX36 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DNAJC28Q9NX36 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNAJC28Q9NX36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNAJC28Q9NX36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNAJC28Q9NX36 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms