Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV2

SPACA1, Sperm acrosome membrane-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA1Q9HBV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPACA1Q9HBV2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPACA1Q9HBV2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPACA1Q9HBV2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPACA1Q9HBV2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPACA1Q9HBV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPACA1Q9HBV2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPACA1Q9HBV2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA1Q9HBV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA1Q9HBV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPACA1Q9HBV2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA1Q9HBV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms