Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX17Q9H6I2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX17Q9H6I2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX17Q9H6I2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX17Q9H6I2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX17Q9H6I2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOX17Q9H6I2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX17Q9H6I2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX17Q9H6I2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX17Q9H6I2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms