Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM117Q9H0C3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM117Q9H0C3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMEM117Q9H0C3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMEM117Q9H0C3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMEM117Q9H0C3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TMEM117Q9H0C3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TMEM117Q9H0C3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TMEM117Q9H0C3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TMEM117Q9H0C3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM117Q9H0C3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TMEM117Q9H0C3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMEM117Q9H0C3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms