Protein–RNA interactions for Protein: Q96J42

TXNDC15, Thioredoxin domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC15Q96J42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC15Q96J42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC15Q96J42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TXNDC15Q96J42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TXNDC15Q96J42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TXNDC15Q96J42 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TXNDC15Q96J42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TXNDC15Q96J42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TXNDC15Q96J42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TXNDC15Q96J42 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TXNDC15Q96J42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms