Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms