Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCAIQ8N9R8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAIQ8N9R8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAIQ8N9R8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAIQ8N9R8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAIQ8N9R8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAIQ8N9R8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAIQ8N9R8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAIQ8N9R8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAIQ8N9R8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAIQ8N9R8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAIQ8N9R8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAIQ8N9R8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms