Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2H8

SLC36A1, Proton-coupled amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A1Q7Z2H8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC36A1Q7Z2H8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC36A1Q7Z2H8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC36A1Q7Z2H8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A1Q7Z2H8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A1Q7Z2H8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC36A1Q7Z2H8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC36A1Q7Z2H8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC36A1Q7Z2H8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC36A1Q7Z2H8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms