Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF43Q68DV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF43Q68DV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF43Q68DV7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF43Q68DV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF43Q68DV7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF43Q68DV7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF43Q68DV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF43Q68DV7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF43Q68DV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF43Q68DV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RNF43Q68DV7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF43Q68DV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF43Q68DV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms