Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL8BQ17RB0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RTL8BQ17RB0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL8BQ17RB0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RTL8BQ17RB0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTL8BQ17RB0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL8BQ17RB0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTL8BQ17RB0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL8BQ17RB0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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