Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTL8BQ17RB0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTL8BQ17RB0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTL8BQ17RB0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RTL8BQ17RB0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RTL8BQ17RB0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RTL8BQ17RB0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RTL8BQ17RB0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RTL8BQ17RB0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTL8BQ17RB0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RTL8BQ17RB0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTL8BQ17RB0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTL8BQ17RB0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTL8BQ17RB0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTL8BQ17RB0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTL8BQ17RB0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTL8BQ17RB0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTL8BQ17RB0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTL8BQ17RB0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL8BQ17RB0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL8BQ17RB0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTL8BQ17RB0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTL8BQ17RB0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTL8BQ17RB0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTL8BQ17RB0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL8BQ17RB0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTL8BQ17RB0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTL8BQ17RB0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL8BQ17RB0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTL8BQ17RB0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RTL8BQ17RB0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTL8BQ17RB0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTL8BQ17RB0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL8BQ17RB0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL8BQ17RB0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTL8BQ17RB0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTL8BQ17RB0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTL8BQ17RB0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTL8BQ17RB0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTL8BQ17RB0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTL8BQ17RB0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL8BQ17RB0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTL8BQ17RB0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL8BQ17RB0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL8BQ17RB0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTL8BQ17RB0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL8BQ17RB0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL8BQ17RB0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTL8BQ17RB0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTL8BQ17RB0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL8BQ17RB0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTL8BQ17RB0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTL8BQ17RB0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTL8BQ17RB0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTL8BQ17RB0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTL8BQ17RB0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTL8BQ17RB0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTL8BQ17RB0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTL8BQ17RB0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTL8BQ17RB0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTL8BQ17RB0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL8BQ17RB0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTL8BQ17RB0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTL8BQ17RB0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL8BQ17RB0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTL8BQ17RB0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL8BQ17RB0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL8BQ17RB0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTL8BQ17RB0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL8BQ17RB0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTL8BQ17RB0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTL8BQ17RB0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTL8BQ17RB0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTL8BQ17RB0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL8BQ17RB0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTL8BQ17RB0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTL8BQ17RB0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTL8BQ17RB0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTL8BQ17RB0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTL8BQ17RB0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL8BQ17RB0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL8BQ17RB0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTL8BQ17RB0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RTL8BQ17RB0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTL8BQ17RB0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTL8BQ17RB0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTL8BQ17RB0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTL8BQ17RB0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTL8BQ17RB0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTL8BQ17RB0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL8BQ17RB0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTL8BQ17RB0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTL8BQ17RB0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTL8BQ17RB0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL8BQ17RB0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTL8BQ17RB0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTL8BQ17RB0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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