Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNMA1Q12791 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNMA1Q12791 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNMA1Q12791 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNMA1Q12791 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNMA1Q12791 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNMA1Q12791 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMA1Q12791 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMA1Q12791 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMA1Q12791 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNMA1Q12791 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNMA1Q12791 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNMA1Q12791 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNMA1Q12791 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNMA1Q12791 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNMA1Q12791 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNMA1Q12791 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNMA1Q12791 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNMA1Q12791 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
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