Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KCNMA1Q12791 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KCNMA1Q12791 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNMA1Q12791 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNMA1Q12791 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
KCNMA1Q12791 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
KCNMA1Q12791 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KCNMA1Q12791 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KCNMA1Q12791 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KCNMA1Q12791 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KCNMA1Q12791 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KCNMA1Q12791 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KCNMA1Q12791 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KCNMA1Q12791 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KCNMA1Q12791 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KCNMA1Q12791 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KCNMA1Q12791 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KCNMA1Q12791 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KCNMA1Q12791 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNMA1Q12791 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNMA1Q12791 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNMA1Q12791 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
KCNMA1Q12791 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNMA1Q12791 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KCNMA1Q12791 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNMA1Q12791 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KCNMA1Q12791 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNMA1Q12791 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNMA1Q12791 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNMA1Q12791 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNMA1Q12791 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNMA1Q12791 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNMA1Q12791 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNMA1Q12791 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNMA1Q12791 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KCNMA1Q12791 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
KCNMA1Q12791 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNMA1Q12791 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KCNMA1Q12791 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNMA1Q12791 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KCNMA1Q12791 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
KCNMA1Q12791 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KCNMA1Q12791 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KCNMA1Q12791 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNMA1Q12791 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNMA1Q12791 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNMA1Q12791 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KCNMA1Q12791 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KCNMA1Q12791 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNMA1Q12791 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KCNMA1Q12791 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KCNMA1Q12791 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KCNMA1Q12791 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KCNMA1Q12791 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KCNMA1Q12791 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KCNMA1Q12791 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KCNMA1Q12791 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KCNMA1Q12791 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNMA1Q12791 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNMA1Q12791 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNMA1Q12791 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNMA1Q12791 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCNMA1Q12791 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCNMA1Q12791 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KCNMA1Q12791 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNMA1Q12791 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNMA1Q12791 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KCNMA1Q12791 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KCNMA1Q12791 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KCNMA1Q12791 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KCNMA1Q12791 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNMA1Q12791 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KCNMA1Q12791 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KCNMA1Q12791 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KCNMA1Q12791 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KCNMA1Q12791 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KCNMA1Q12791 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KCNMA1Q12791 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KCNMA1Q12791 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KCNMA1Q12791 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
KCNMA1Q12791 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
KCNMA1Q12791 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KCNMA1Q12791 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
KCNMA1Q12791 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KCNMA1Q12791 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KCNMA1Q12791 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
KCNMA1Q12791 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
KCNMA1Q12791 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KCNMA1Q12791 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCNMA1Q12791 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCNMA1Q12791 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KCNMA1Q12791 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KCNMA1Q12791 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KCNMA1Q12791 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KCNMA1Q12791 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KCNMA1Q12791 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
KCNMA1Q12791 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KCNMA1Q12791 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KCNMA1Q12791 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KCNMA1Q12791 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
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