Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OCA2Q04671 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
OCA2Q04671 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OCA2Q04671 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OCA2Q04671 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OCA2Q04671 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OCA2Q04671 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OCA2Q04671 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms