Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
OCA2Q04671 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
OCA2Q04671 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
OCA2Q04671 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
OCA2Q04671 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
OCA2Q04671 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
OCA2Q04671 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
OCA2Q04671 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
OCA2Q04671 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
OCA2Q04671 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
OCA2Q04671 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
OCA2Q04671 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
OCA2Q04671 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
OCA2Q04671 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
OCA2Q04671 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
OCA2Q04671 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
OCA2Q04671 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OCA2Q04671 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OCA2Q04671 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
OCA2Q04671 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
OCA2Q04671 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
OCA2Q04671 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
OCA2Q04671 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
OCA2Q04671 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
OCA2Q04671 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
OCA2Q04671 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
OCA2Q04671 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
OCA2Q04671 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OCA2Q04671 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OCA2Q04671 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
OCA2Q04671 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OCA2Q04671 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OCA2Q04671 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OCA2Q04671 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OCA2Q04671 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
OCA2Q04671 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
OCA2Q04671 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
OCA2Q04671 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
OCA2Q04671 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
OCA2Q04671 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
OCA2Q04671 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
OCA2Q04671 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
OCA2Q04671 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OCA2Q04671 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
OCA2Q04671 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
OCA2Q04671 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
OCA2Q04671 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
OCA2Q04671 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
OCA2Q04671 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
OCA2Q04671 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OCA2Q04671 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
OCA2Q04671 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OCA2Q04671 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OCA2Q04671 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OCA2Q04671 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OCA2Q04671 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
OCA2Q04671 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
OCA2Q04671 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
OCA2Q04671 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
OCA2Q04671 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OCA2Q04671 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OCA2Q04671 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OCA2Q04671 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OCA2Q04671 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
OCA2Q04671 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OCA2Q04671 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OCA2Q04671 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OCA2Q04671 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OCA2Q04671 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OCA2Q04671 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OCA2Q04671 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OCA2Q04671 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OCA2Q04671 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OCA2Q04671 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OCA2Q04671 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OCA2Q04671 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OCA2Q04671 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
OCA2Q04671 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OCA2Q04671 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OCA2Q04671 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OCA2Q04671 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OCA2Q04671 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
OCA2Q04671 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OCA2Q04671 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OCA2Q04671 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OCA2Q04671 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OCA2Q04671 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OCA2Q04671 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
OCA2Q04671 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OCA2Q04671 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OCA2Q04671 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OCA2Q04671 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
OCA2Q04671 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OCA2Q04671 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OCA2Q04671 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OCA2Q04671 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
OCA2Q04671 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OCA2Q04671 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OCA2Q04671 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OCA2Q04671 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms