Protein–RNA interactions for Protein: P51553

IDH3G, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3GP51553 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IDH3GP51553 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IDH3GP51553 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IDH3GP51553 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IDH3GP51553 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IDH3GP51553 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IDH3GP51553 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IDH3GP51553 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IDH3GP51553 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms