Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEACAM6P40199 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEACAM6P40199 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEACAM6P40199 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM6P40199 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEACAM6P40199 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEACAM6P40199 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM6P40199 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms