Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BMI1P35226 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BMI1P35226 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BMI1P35226 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BMI1P35226 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BMI1P35226 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BMI1P35226 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BMI1P35226 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BMI1P35226 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BMI1P35226 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BMI1P35226 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BMI1P35226 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMI1P35226 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMI1P35226 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMI1P35226 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMI1P35226 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMI1P35226 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMI1P35226 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMI1P35226 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMI1P35226 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BMI1P35226 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BMI1P35226 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BMI1P35226 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BMI1P35226 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMI1P35226 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BMI1P35226 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMI1P35226 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMI1P35226 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMI1P35226 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BMI1P35226 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMI1P35226 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMI1P35226 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMI1P35226 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BMI1P35226 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMI1P35226 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BMI1P35226 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BMI1P35226 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BMI1P35226 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BMI1P35226 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BMI1P35226 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BMI1P35226 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BMI1P35226 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BMI1P35226 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BMI1P35226 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BMI1P35226 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BMI1P35226 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BMI1P35226 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BMI1P35226 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BMI1P35226 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BMI1P35226 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BMI1P35226 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BMI1P35226 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BMI1P35226 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BMI1P35226 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BMI1P35226 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BMI1P35226 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BMI1P35226 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BMI1P35226 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BMI1P35226 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BMI1P35226 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BMI1P35226 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BMI1P35226 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BMI1P35226 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BMI1P35226 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMI1P35226 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMI1P35226 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BMI1P35226 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMI1P35226 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BMI1P35226 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BMI1P35226 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BMI1P35226 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMI1P35226 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BMI1P35226 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BMI1P35226 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BMI1P35226 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BMI1P35226 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BMI1P35226 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BMI1P35226 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BMI1P35226 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BMI1P35226 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BMI1P35226 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BMI1P35226 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BMI1P35226 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BMI1P35226 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BMI1P35226 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BMI1P35226 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BMI1P35226 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BMI1P35226 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BMI1P35226 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BMI1P35226 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BMI1P35226 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BMI1P35226 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BMI1P35226 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BMI1P35226 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms