Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMI1P35226 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BMI1P35226 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BMI1P35226 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BMI1P35226 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMI1P35226 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMI1P35226 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMI1P35226 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BMI1P35226 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMI1P35226 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMI1P35226 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMI1P35226 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BMI1P35226 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BMI1P35226 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BMI1P35226 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BMI1P35226 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BMI1P35226 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BMI1P35226 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BMI1P35226 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BMI1P35226 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BMI1P35226 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BMI1P35226 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BMI1P35226 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMI1P35226 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BMI1P35226 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BMI1P35226 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BMI1P35226 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMI1P35226 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BMI1P35226 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BMI1P35226 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BMI1P35226 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMI1P35226 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMI1P35226 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMI1P35226 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BMI1P35226 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BMI1P35226 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMI1P35226 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BMI1P35226 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BMI1P35226 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BMI1P35226 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BMI1P35226 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BMI1P35226 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BMI1P35226 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BMI1P35226 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BMI1P35226 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BMI1P35226 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BMI1P35226 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BMI1P35226 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMI1P35226 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMI1P35226 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMI1P35226 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMI1P35226 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMI1P35226 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMI1P35226 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMI1P35226 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMI1P35226 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMI1P35226 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMI1P35226 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMI1P35226 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMI1P35226 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMI1P35226 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMI1P35226 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMI1P35226 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BMI1P35226 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BMI1P35226 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMI1P35226 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMI1P35226 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMI1P35226 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BMI1P35226 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BMI1P35226 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMI1P35226 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BMI1P35226 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BMI1P35226 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BMI1P35226 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BMI1P35226 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BMI1P35226 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BMI1P35226 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BMI1P35226 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMI1P35226 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BMI1P35226 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BMI1P35226 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BMI1P35226 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BMI1P35226 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMI1P35226 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMI1P35226 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMI1P35226 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMI1P35226 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMI1P35226 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMI1P35226 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BMI1P35226 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BMI1P35226 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BMI1P35226 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BMI1P35226 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BMI1P35226 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BMI1P35226 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BMI1P35226 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMI1P35226 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BMI1P35226 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BMI1P35226 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BMI1P35226 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms