Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NELFEP18615 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NELFEP18615 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFEP18615 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFEP18615 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFEP18615 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFEP18615 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NELFEP18615 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NELFEP18615 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NELFEP18615 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NELFEP18615 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFEP18615 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFEP18615 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFEP18615 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFEP18615 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFEP18615 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NELFEP18615 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NELFEP18615 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NELFEP18615 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NELFEP18615 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFEP18615 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFEP18615 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFEP18615 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFEP18615 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFEP18615 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFEP18615 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFEP18615 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFEP18615 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFEP18615 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFEP18615 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NELFEP18615 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFEP18615 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFEP18615 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFEP18615 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NELFEP18615 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFEP18615 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFEP18615 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFEP18615 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFEP18615 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NELFEP18615 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFEP18615 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFEP18615 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFEP18615 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFEP18615 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NELFEP18615 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NELFEP18615 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NELFEP18615 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NELFEP18615 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFEP18615 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFEP18615 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFEP18615 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFEP18615 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFEP18615 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFEP18615 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFEP18615 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFEP18615 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFEP18615 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFEP18615 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFEP18615 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFEP18615 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFEP18615 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFEP18615 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFEP18615 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFEP18615 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFEP18615 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NELFEP18615 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELFEP18615 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NELFEP18615 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NELFEP18615 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NELFEP18615 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFEP18615 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NELFEP18615 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFEP18615 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFEP18615 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NELFEP18615 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELFEP18615 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NELFEP18615 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NELFEP18615 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFEP18615 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFEP18615 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFEP18615 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFEP18615 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFEP18615 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFEP18615 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFEP18615 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFEP18615 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFEP18615 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFEP18615 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFEP18615 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFEP18615 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFEP18615 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFEP18615 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFEP18615 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms