Protein–RNA interactions for Protein: F8VTS6

RFPL4AL1, Ret finger protein-like 4A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4AL1F8VTS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFPL4AL1F8VTS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFPL4AL1F8VTS6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFPL4AL1F8VTS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFPL4AL1F8VTS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFPL4AL1F8VTS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFPL4AL1F8VTS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFPL4AL1F8VTS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFPL4AL1F8VTS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms