Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6I4

IGLV10-54, Immunoglobulin lambda variable 10-54, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV10-54A0A075B6I4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGLV10-54A0A075B6I4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGLV10-54A0A075B6I4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGLV10-54A0A075B6I4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGLV10-54A0A075B6I4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IGLV10-54A0A075B6I4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IGLV10-54A0A075B6I4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGLV10-54A0A075B6I4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IGLV10-54A0A075B6I4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGLV10-54A0A075B6I4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGLV10-54A0A075B6I4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGLV10-54A0A075B6I4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGLV10-54A0A075B6I4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms