Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 SCRIB-207ENST00000531942 421 ntTSL 219.96■□□□□ 0.793e-6■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-6■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CDCA5-208ENST00000529290 789 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 TBC1D14-209ENST00000467966 627 ntTSL 312.09□□□□□ -0.472e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CALM3-207ENST00000595072 721 ntTSL 210.32□□□□□ -0.762e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 28.98□□□□□ -0.972e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 28.9□□□□□ -0.992e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 58.76□□□□□ -1.012e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 AC097382.1-201ENST00000441093 591 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.122e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.161e-9■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CALM3-204ENST00000482455 650 ntTSL 47.62□□□□□ -1.192e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 GTPBP2-207ENST00000459959 721 ntTSL 27.42□□□□□ -1.222e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.312e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 26.71□□□□□ -1.341e-9■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.382e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 TBC1D14-202ENST00000410031 4201 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.42e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 46.26□□□□□ -1.412e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.52□□□□□ -1.532e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)4.59□□□□□ -1.672e-8■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 21.9□□□□□ -2.111e-9■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 313.62□□□□□ -0.239e-16■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 212.96□□□□□ -0.349e-16■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 212.38□□□□□ -0.439e-16■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 28.78□□□□□ -19e-16■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 LINC00958-203ENST00000527945 1121 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.136e-7■■■□□ 15.6
NIPBLQ6KC79 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-6■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.933e-6■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.343e-6■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 25.21□□□□□ -1.583e-6■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.144e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.194e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.374e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-214ENST00000480385 614 ntTSL 54.35□□□□□ -1.714e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.734e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.774e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.864e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.587e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.877e-7■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.321e-11■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.466e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.586e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 59.6□□□□□ -0.876e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.026e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.026e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 56.82□□□□□ -1.326e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.456e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.796e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.96e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 20.5□□□□□ -2.336e-21■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 514.06□□□□□ -0.162e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 311.45□□□□□ -0.582e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 311.45□□□□□ -0.582e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.752e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.982e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.982e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.072e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 37.7□□□□□ -1.182e-15■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 39.02□□□□□ -0.977e-20■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 311.57□□□□□ -0.562e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-202ENST00000502548 1090 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-223ENST00000510199 1100 ntTSL 39.45□□□□□ -0.92e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-225ENST00000511566 825 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-224ENST00000511473 1150 ntTSL 59.09□□□□□ -0.952e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-229ENST00000513027 697 ntTSL 38.97□□□□□ -0.972e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-206ENST00000503081 587 ntTSL 38.78□□□□□ -12e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-219ENST00000508682 1208 ntTSL 58.78□□□□□ -12e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-208ENST00000503494 843 ntTSL 38.72□□□□□ -1.012e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 38.7□□□□□ -1.022e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 58.67□□□□□ -1.022e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-228ENST00000512968 1058 ntTSL 58.62□□□□□ -1.032e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-234ENST00000515417 873 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-212ENST00000505461 1005 ntTSL 58.34□□□□□ -1.072e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-213ENST00000506312 559 ntTSL 58.33□□□□□ -1.082e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-210ENST00000504325 1098 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.22e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.212e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-211ENST00000504726 388 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.222e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.242e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.292e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-215ENST00000507261 590 ntTSL 36.71□□□□□ -1.342e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-231ENST00000514183 1439 ntTSL 26.17□□□□□ -1.422e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 RACK1-214ENST00000507000 685 ntTSL 56.09□□□□□ -1.432e-13■■■□□ 15.5
NIPBLQ6KC79 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.522e-13■■■□□ 15.5
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 51.8 ms