Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.691e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.461e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 223.31■■□□□ 1.321e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 323.31■■□□□ 1.321e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 320.68■□□□□ 0.91e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.481e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.711e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-22■■■□□ 15.8
AATFQ9NY61 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.244e-49■■■□□ 15.7
AATFQ9NY61 SNHG7-202ENST00000416970 789 ntTSL 1 (best)28.6■■■□□ 2.173e-72■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.133e-72■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.73e-72■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.17□□□□□ -1.263e-72■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.263e-72■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 TPST2-205ENST00000442495 586 ntTSL 226.53■■□□□ 1.843e-10■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.693e-10■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.571e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 TPST2-207ENST00000450022 544 ntTSL 324.79■■□□□ 1.563e-10■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.53e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 DAPK3-204ENST00000594894 617 ntTSL 324.41■■□□□ 1.53e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.483e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)24.24■■□□□ 1.471e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 DAPK3-205ENST00000595279 2058 ntTSL 223.85■■□□□ 1.413e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 TPST2-204ENST00000440953 544 ntTSL 522.39■■□□□ 1.173e-10■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ITGA5-213ENST00000553071 1013 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.93e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.831e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.683e-10■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.621e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ITGA5-202ENST00000435631 1240 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.431e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 PPP1R12C-204ENST00000586992 4141 nt17.48■□□□□ 0.391e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-208ENST00000558970 730 ntTSL 515.04■□□□□ -03e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.213e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-215ENST00000510166 532 ntTSL 310.97□□□□□ -0.651e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.823e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-204ENST00000441319 591 ntTSL 47.32□□□□□ -1.241e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.321e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.371e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-205ENST00000476441 1604 ntTSL 56.49□□□□□ -1.371e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.441e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.471e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.531e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.583e-7■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 PIP5K1C-207ENST00000636612 153 ntTSL 54.95□□□□□ -1.621e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-218ENST00000515133 665 ntTSL 24.13□□□□□ -1.751e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ALB-217ENST00000514786 577 ntTSL 41.51□□□□□ -2.171e-5■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.383e-6■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.963e-6■■■□□ 15.6
AATFQ9NY61 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 523.27■■□□□ 1.323e-8■■■□□ 15.4
AATFQ9NY61 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 322.99■■□□□ 1.273e-8■■■□□ 15.4
AATFQ9NY61 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.713e-8■■■□□ 15.4
AATFQ9NY61 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.681e-10■■■□□ 15.4
AATFQ9NY61 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt18.58■□□□□ 0.561e-10■■■□□ 15.4
AATFQ9NY61 TAL1-204ENST00000464796 237 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.681e-6■■■□□ 15.4
AATFQ9NY61 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-6■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.036e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 227.24■■□□□ 1.954e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.415e-10■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 AL390728.4-204ENST00000606454 660 ntTSL 318.46■□□□□ 0.555e-10■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.444e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 AL390728.4-203ENST00000606212 637 ntTSL 316.4■□□□□ 0.225e-10■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 316.01■□□□□ 0.154e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 315.97■□□□□ 0.154e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 215.88■□□□□ 0.134e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 AL390728.4-202ENST00000606173 430 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.085e-10■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.164e-7■■■□□ 15.2
AATFQ9NY61 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 530.56■■■□□ 2.487e-6■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.477e-6■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 324.24■■□□□ 1.477e-6■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.297e-6■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.137e-6■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 218.96■□□□□ 0.637e-6■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.161e-8■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.781e-8■■■□□ 15.1
AATFQ9NY61 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 228.52■■■□□ 2.166e-64■■■□□ 15
AATFQ9NY61 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 221.35■■□□□ 1.016e-64■■■□□ 15
AATFQ9NY61 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 319.99■□□□□ 0.796e-64■■■□□ 15
AATFQ9NY61 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.426e-64■■■□□ 15
AATFQ9NY61 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.566e-64■■■□□ 15
AATFQ9NY61 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 224.6■■□□□ 1.531e-6■■■□□ 15
AATFQ9NY61 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.431e-6■■■□□ 15
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