Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 15e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 KRI1-215ENST00000618579 516 ntTSL 320.79■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.875e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 GMPPA-208ENST00000455657 907 ntTSL 520.27■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 GRHPR-203ENST00000460882 1080 ntTSL 1 (best)19.62■□□□□ 0.734e-13■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TPRN-201ENST00000333046 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.95■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-212ENST00000567756 571 ntTSL 318.9■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.23■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 KRI1-206ENST00000537363 2255 ntTSL 517.34■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ATP9B-222ENST00000590477 1784 ntTSL 216.87■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ATP9B-216ENST00000588921 1511 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-205ENST00000561617 812 ntTSL 516.21■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 416.11■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-214ENST00000569057 1036 ntTSL 515.98■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.045e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 GMPPA-210ENST00000480506 835 ntTSL 514.97□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-214ENST00000630850 3442 ntTSL 214.89□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-9■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ZFYVE19-206ENST00000561768 1486 ntTSL 513.94□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TPRN-203ENST00000477345 3350 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 213.5□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 GMPPA-206ENST00000435316 786 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 KRI1-204ENST00000536689 3744 ntTSL 212.99□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-13■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 GMPPA-214ENST00000635609 569 ntTSL 512.64□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 PHF21A-207ENST00000527401 8954 ntTSL 211.24□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACP2-214ENST00000534752 274 ntTSL 510.28□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.795e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TNFAIP8-204ENST00000503646 2502 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TADA1-202ENST00000467021 2539 ntTSL 27.97□□□□□ -1.135e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DENND4A-203ENST00000561863 480 ntTSL 27.8□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.275e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 ASB3-203ENST00000406053 2648 ntTSL 56.4□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SPART-208ENST00000491805 668 ntTSL 26.27□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.02□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.495e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.585e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.955e-7■■■■■ 30.4
PABPC4Q13310 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.116e-10■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 MTMR12-202ENST00000280285 4966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-10■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.983e-10■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 WDR46-235ENST00000473611 872 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 WDR46-233ENST00000461951 669 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 30.3
PABPC4Q13310 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.554e-10■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.284e-10■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 DCAF17-205ENST00000468592 2429 ntTSL 25.03□□□□□ -1.64e-10■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 210.64□□□□□ -0.714e-13■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 517.5■□□□□ 0.394e-11■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.224e-11■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 215.43■□□□□ 0.064e-11■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.054e-11■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.713e-6■■■■■ 30.2
PABPC4Q13310 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.365e-7■■■■■ 30.2
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