Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 59.89□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 27.55□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 37.01□□□□□ -1.291e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.381e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.421e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 24.63□□□□□ -1.671e-6■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 210.09□□□□□ -0.791e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.321e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.381e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.481e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.591e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 24.97□□□□□ -1.611e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.651e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.671e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.791e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 32.88□□□□□ -1.951e-323■■■□□ 16.4
AATFQ9NY61 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.817e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-203ENST00000420199 1002 ntTSL 318.83■□□□□ 0.67e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 517.66■□□□□ 0.427e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 216.99■□□□□ 0.317e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.097e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 314.87□□□□□ -0.037e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 214.84□□□□□ -0.037e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.17e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-207ENST00000431043 998 ntTSL 214.43□□□□□ -0.17e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-212ENST00000589187 568 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.237e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-202ENST00000414002 430 ntTSL 211.93□□□□□ -0.57e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 210.59□□□□□ -0.717e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 59.65□□□□□ -0.867e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.167e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 56.6□□□□□ -1.357e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.357e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.667e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 SNHG5-205ENST00000427501 680 ntTSL 24.19□□□□□ -1.747e-20■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt34.92■■■■□ 3.185e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-202ENST00000586270 468 ntTSL 230.04■■■□□ 2.45e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-209ENST00000589949 842 ntTSL 222.12■■□□□ 1.135e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-207ENST00000589417 575 ntTSL 221.35■■□□□ 1.015e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.885e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-213ENST00000593254 894 ntTSL 516.12■□□□□ 0.175e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-205ENST00000587171 586 ntTSL 216.12■□□□□ 0.175e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.025e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.15e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.35e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.515e-11■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 ATP5B-211ENST00000553007 814 ntTSL 522.99■■□□□ 1.273e-8■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 ATP5B-210ENST00000552959 1085 ntTSL 322.98■■□□□ 1.273e-8■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 519.48■□□□□ 0.713e-8■■■□□ 16.3
AATFQ9NY61 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 233.84■■■■□ 3.012e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.192e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.762e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 323.91■■□□□ 1.422e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 522.46■■□□□ 1.192e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 318.02■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.475e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RPL35A-208ENST00000485439 677 ntTSL 29.52□□□□□ -0.895e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RPL35A-209ENST00000496582 579 ntTSL 28.51□□□□□ -1.055e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RPL35A-201ENST00000329092 456 ntTSL 37.03□□□□□ -1.285e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 55.76□□□□□ -1.495e-6■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-12■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-12■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-12■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.521e-21■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.197e-7■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.067e-7■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RACK1-204ENST00000502890 705 ntTSL 312.23□□□□□ -0.453e-19■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 311.7□□□□□ -0.543e-19■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 510.49□□□□□ -0.733e-19■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC8.05□□□□□ -1.123e-19■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 NOP56-208ENST00000467857 735 ntTSL 210.53□□□□□ -0.723e-39■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.653e-39■■■□□ 16.2
AATFQ9NY61 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.7■□□□□ 0.426e-17■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.196e-17■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHD3-208ENST00000470531 3744 ntTSL 212.12□□□□□ -0.476e-17■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.556e-17■■■□□ 16
AATFQ9NY61 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.696e-17■■■□□ 16
AATFQ9NY61 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.063e-8■■■□□ 16
AATFQ9NY61 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.933e-8■■■□□ 16
AATFQ9NY61 DYNC1LI2-212ENST00000568180 573 ntTSL 520.72■□□□□ 0.913e-8■■■□□ 16
AATFQ9NY61 DYNC1LI2-210ENST00000566150 568 ntTSL 320.43■□□□□ 0.863e-8■■■□□ 16
AATFQ9NY61 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-8■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 223■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)21.97■■□□□ 1.111e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)21.74■■□□□ 1.071e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.831e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 16
AATFQ9NY61 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 16
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