RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586518.1

H3F3B-203, Transcript of H3 histone family member 3B, humanhuman

Gene H3F3B, Length 1,701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3B-203ENST00000586518 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.1■■■■■ 8.17
H3F3B-203ENST00000586518 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.45■■■■■ 6.79
H3F3B-203ENST00000586518 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.6■■■■■ 6.49
H3F3B-203ENST00000586518 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.71■■■■■ 6.35
H3F3B-203ENST00000586518 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.58■■■■■ 6.33
H3F3B-203ENST00000586518 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.26■■■■■ 6.28
H3F3B-203ENST00000586518 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.89■■■■■ 6.22
H3F3B-203ENST00000586518 ABCC9O60706 1549 aa53.86■■■■■ 6.21
H3F3B-203ENST00000586518 NACADO15069 1562 aa53.44■■■■■ 6.15
H3F3B-203ENST00000586518 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.88■■■■■ 6.06
H3F3B-203ENST00000586518 SCRIBQ14160 1630 aa52.85■■■■■ 6.05
H3F3B-203ENST00000586518 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.55■■■■■ 6
H3F3B-203ENST00000586518 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.65■■■■■ 5.86
H3F3B-203ENST00000586518 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.45■■■■■ 5.83
H3F3B-203ENST00000586518 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.25■■■■■ 5.79
H3F3B-203ENST00000586518 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.09■■■■■ 5.77
H3F3B-203ENST00000586518 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.07■■■■■ 5.77
H3F3B-203ENST00000586518 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.03■■■■■ 5.76
H3F3B-203ENST00000586518 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.89■■■■■ 5.74
H3F3B-203ENST00000586518 SMARCA4P51532 1647 aa50.7■■■■■ 5.71
H3F3B-203ENST00000586518 WIZO95785 1651 aa50.65■■■■■ 5.7
H3F3B-203ENST00000586518 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.52■■■■■ 5.68
H3F3B-203ENST00000586518 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.21■■■■■ 5.63
H3F3B-203ENST00000586518 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.06■■■■■ 5.6
H3F3B-203ENST00000586518 SMARCA2P51531 1590 aa49.83■■■■■ 5.57
H3F3B-203ENST00000586518 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.76■■■■■ 5.56
H3F3B-203ENST00000586518 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.68■■■■■ 5.54
H3F3B-203ENST00000586518 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
H3F3B-203ENST00000586518 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.57■■■■■ 5.53
H3F3B-203ENST00000586518 TRIM41Q8WV44 630 aa49.45■■■■■ 5.51
H3F3B-203ENST00000586518 NCAPD3P42695 1498 aa49.28■■■■■ 5.48
H3F3B-203ENST00000586518 HMGXB3Q12766 1538 aa49.25■■■■■ 5.47
H3F3B-203ENST00000586518 ABCC8Q09428 1581 aa48.74■■■■■ 5.39
H3F3B-203ENST00000586518 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.74■■■■■ 5.39
H3F3B-203ENST00000586518 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.56■■■■■ 5.36
H3F3B-203ENST00000586518 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.49■■■■■ 5.357e-8■□□□□ 11.3
H3F3B-203ENST00000586518 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.47■■■■■ 5.35
H3F3B-203ENST00000586518 CFTRP13569 1480 aa48.3■■■■■ 5.32
H3F3B-203ENST00000586518 EEA1Q15075 1411 aa48.17■■■■■ 5.3
H3F3B-203ENST00000586518 SYNJ1O43426 1573 aa48.15■■■■■ 5.3
H3F3B-203ENST00000586518 PRDM2Q13029 1718 aa48.1■■■■■ 5.29
H3F3B-203ENST00000586518 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.08■■■■■ 5.29
H3F3B-203ENST00000586518 TOP2BQ02880 1626 aa48■■■■■ 5.27
H3F3B-203ENST00000586518 SOGA1O94964 1423 aa47.96■■■■■ 5.27
H3F3B-203ENST00000586518 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.93■■■■■ 5.26
H3F3B-203ENST00000586518 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.81■■■■■ 5.24
H3F3B-203ENST00000586518 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.73■■■■■ 5.23
H3F3B-203ENST00000586518 CUX1P39880 1505 aa47.69■■■■■ 5.23
H3F3B-203ENST00000586518 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.69■■■■■ 5.22
H3F3B-203ENST00000586518 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.56■■■■■ 5.2
H3F3B-203ENST00000586518 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.53■■■■■ 5.2
H3F3B-203ENST00000586518 GOLGA3Q08378 1498 aa47.46■■■■■ 5.19
H3F3B-203ENST00000586518 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.42■■■■■ 5.18
H3F3B-203ENST00000586518 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.41■■■■■ 5.18
H3F3B-203ENST00000586518 KIF21BO75037 1637 aa47.4■■■■■ 5.18
H3F3B-203ENST00000586518 NESP48681 1621 aa47.36■■■■■ 5.17
H3F3B-203ENST00000586518 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
H3F3B-203ENST00000586518 KIF27Q86VH2 1401 aa47.28■■■■■ 5.16
H3F3B-203ENST00000586518 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.24■■■■■ 5.15
H3F3B-203ENST00000586518 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.2■■■■■ 5.15
H3F3B-203ENST00000586518 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.16■■■■■ 5.14
H3F3B-203ENST00000586518 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.15■■■■■ 5.14
H3F3B-203ENST00000586518 CEP162Q5TB80 1403 aa47.13■■■■■ 5.14
H3F3B-203ENST00000586518 TOPBP1Q92547 1522 aa47.05■■■■■ 5.12
H3F3B-203ENST00000586518 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.01■■■■■ 5.12
H3F3B-203ENST00000586518 CUX2O14529 1486 aa46.99■■■■■ 5.11
H3F3B-203ENST00000586518 PRXQ9BXM0 1461 aa46.97■■■■■ 5.11
H3F3B-203ENST00000586518 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.97■■■■■ 5.11
H3F3B-203ENST00000586518 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.95■■■■■ 5.11
H3F3B-203ENST00000586518 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
H3F3B-203ENST00000586518 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
H3F3B-203ENST00000586518 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
H3F3B-203ENST00000586518 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.83■■■■■ 5.09
H3F3B-203ENST00000586518 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.77■■■■■ 5.08
H3F3B-203ENST00000586518 IGF1RP08069 1367 aa46.72■■■■■ 5.07
H3F3B-203ENST00000586518 CLIP1P30622 1438 aa46.7■■■■■ 5.07
H3F3B-203ENST00000586518 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.67■■■■■ 5.06
H3F3B-203ENST00000586518 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.56■■■■■ 5.04
H3F3B-203ENST00000586518 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.53■■■■■ 5.04
H3F3B-203ENST00000586518 WDR97A6NE52 1622 aa46.49■■■■■ 5.03
H3F3B-203ENST00000586518 CUL7Q14999 1698 aa46.38■■■■■ 5.01
H3F3B-203ENST00000586518 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.35■■■■■ 5.01
H3F3B-203ENST00000586518 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.3■■■■■ 5
H3F3B-203ENST00000586518 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
H3F3B-203ENST00000586518 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
H3F3B-203ENST00000586518 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.25■■■■■ 4.99
H3F3B-203ENST00000586518 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
H3F3B-203ENST00000586518 ERCC6Q03468 1493 aa46.24■■■■■ 4.99
H3F3B-203ENST00000586518 WDR62O43379 1518 aa46.22■■■■■ 4.99
H3F3B-203ENST00000586518 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
H3F3B-203ENST00000586518 APLP2Q06481 763 aa46.15■■■■■ 4.98
H3F3B-203ENST00000586518 IFT140Q96RY7 1462 aa46.08■■■■■ 4.97
H3F3B-203ENST00000586518 ARAP1Q96P48 1450 aa46.07■■■■■ 4.97
H3F3B-203ENST00000586518 HRCP23327 699 aa46.01■■■■■ 4.96
H3F3B-203ENST00000586518 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46■■■■■ 4.95
H3F3B-203ENST00000586518 PBRM1Q86U86 1689 aa45.91■■■■■ 4.94
H3F3B-203ENST00000586518 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
H3F3B-203ENST00000586518 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.89■■■■■ 4.94
H3F3B-203ENST00000586518 GRIN2BQ13224 1484 aa45.84■■■■■ 4.93
H3F3B-203ENST00000586518 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.82■■■■■ 4.932e-9■■■■□ 20.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms