Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.293e-8■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.037e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.597e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.57e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.397e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.387e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.357e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.277e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-8■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.073e-8■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 ATP5B-206ENST00000550162 863 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.257e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 513.46□□□□□ -0.267e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 LDHA-208ENST00000469976 656 ntTSL 212.91□□□□□ -0.343e-17■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-204ENST00000462026 599 ntTSL 512.46□□□□□ -0.417e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 412.33□□□□□ -0.447e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 EEF1G-202ENST00000524420 557 ntTSL 412.27□□□□□ -0.457e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 512.26□□□□□ -0.457e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.497e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.667e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 ST6GAL1-218ENST00000464827 494 ntTSL 210.71□□□□□ -0.697e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CNOT1-207ENST00000565605 739 ntTSL 410.52□□□□□ -0.737e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.757e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-206ENST00000477455 696 ntTSL 39.2□□□□□ -0.947e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 28.99□□□□□ -0.977e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 28.91□□□□□ -0.987e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 ST6GAL1-213ENST00000448449 1055 ntTSL 58.17□□□□□ -1.17e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 ST6GAL1-209ENST00000442023 570 ntTSL 48.01□□□□□ -1.137e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.727e-6■■■□□ 16.5
NOLC1Q14978 GOLGA8B-203ENST00000484716 6114 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.52e-9■■■□□ 16.4
NOLC1Q14978 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 16.4
NOLC1Q14978 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■■■□□ 16.4
NOLC1Q14978 PSME4-206ENST00000476586 1422 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.233e-6■■■□□ 16.4
NOLC1Q14978 PSME4-209ENST00000488687 3073 ntTSL 26.92□□□□□ -1.33e-6■■■□□ 16.4
NOLC1Q14978 PARP1-207ENST00000490921 3165 ntTSL 211.04□□□□□ -0.641e-48■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 FUBP1-206ENST00000474632 639 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 FUBP1-208ENST00000483894 605 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-6■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 FUBP1-211ENST00000489495 2156 ntTSL 24.46□□□□□ -1.72e-6■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 FUBP1-207ENST00000480673 262 ntTSL 34.26□□□□□ -1.732e-6■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.015e-7■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 04e-9■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 512.09□□□□□ -0.474e-9■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.287e-8■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.17e-8■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-8■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-8■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-8■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■□□ 16.3
NOLC1Q14978 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.998e-8■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.518e-8■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.251e-323■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-323■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-323■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 220.95■□□□□ 0.944e-8■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 BAG6-243ENST00000434444 766 ntTSL 319.35■□□□□ 0.692e-9■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 BAG6-251ENST00000452994 880 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-9■■■□□ 16.2
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NOLC1Q14978 BAG6-253ENST00000454165 544 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-9■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 BAG6-241ENST00000428326 1051 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-9■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 BAG6-242ENST00000433828 902 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-9■■■□□ 16.2
NOLC1Q14978 KANSL2-209ENST00000548701 922 ntTSL 310.83□□□□□ -0.681e-323■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 KANSL2-210ENST00000549463 650 ntTSL 58.51□□□□□ -1.051e-323■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC8.22□□□□□ -1.091e-323■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.374e-7■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.34e-9■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.414e-9■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 RPL32P3-205ENST00000507287 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.644e-9■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-9■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-8■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 57.31□□□□□ -1.244e-9■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.133e-8■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.113e-8■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 GRIPAP1-212ENST00000619149 2828 ntTSL 214.08□□□□□ -0.163e-8■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 GRIPAP1-201ENST00000376423 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-8■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-72■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 SNORA71C-201ENST00000364642 134 ntBASIC10.6□□□□□ -0.712e-72■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-8■■■□□ 16.1
NOLC1Q14978 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.623e-6■■■□□ 16
NOLC1Q14978 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 16
NOLC1Q14978 ITM2B-204ENST00000607866 596 ntTSL 36.5□□□□□ -1.373e-6■■■□□ 16
NOLC1Q14978 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 16
NOLC1Q14978 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-9■■■□□ 16
NOLC1Q14978 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-9■■■□□ 16
NOLC1Q14978 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 510.62□□□□□ -0.712e-9■■■□□ 16
NOLC1Q14978 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.871e-323■■■□□ 16
NOLC1Q14978 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.454e-9■■■□□ 16
NOLC1Q14978 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)17.26■□□□□ 0.354e-7■■■□□ 16
NOLC1Q14978 NFATC3-215ENST00000565750 529 ntTSL 37.36□□□□□ -1.234e-10■■■□□ 16
NOLC1Q14978 ITIH2-206ENST00000480387 573 ntTSL 39.41□□□□□ -0.94e-30■■■□□ 16
NOLC1Q14978 ITIH2-203ENST00000429820 767 ntTSL 38.91□□□□□ -0.984e-30■■■□□ 16
NOLC1Q14978 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.379e-7■■■□□ 16
NOLC1Q14978 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 415.17■□□□□ 0.029e-7■■■□□ 16
NOLC1Q14978 LDHA-213ENST00000535451 465 ntTSL 413.32□□□□□ -0.284e-8■■■□□ 16
NOLC1Q14978 LDHA-211ENST00000494573 1154 ntTSL 212.91□□□□□ -0.344e-8■■■□□ 16
NOLC1Q14978 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 522.09■■□□□ 1.133e-26■■■□□ 16
NOLC1Q14978 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 219.06■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 16
NOLC1Q14978 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-8■■■□□ 15.9
NOLC1Q14978 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-8■■■□□ 15.9
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