Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 DPP9-204ENST00000595327 423 ntTSL 314.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 HOXC6-203ENST00000504315 538 ntTSL 314.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TOM1-211ENST00000449508 593 ntTSL 414.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GABBR1-218ENST00000491829 4212 ntTSL 514.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TOM1-219ENST00000608749 553 ntTSL 414.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TOM1-218ENST00000608674 541 ntTSL 414.33□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2A3-214ENST00000574999 776 ntTSL 314.32□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 VPS28-216ENST00000533806 650 ntTSL 314.09□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHF20L1-204ENST00000361997 3237 ntTSL 513.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 IMMP2L-210ENST00000492938 587 ntTSL 313.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF442-203ENST00000438182 1906 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 INO80E-213ENST00000569957 4469 ntTSL 213.06□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF83-213ENST00000598536 522 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 DPP9-207ENST00000597145 4257 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 NFYB-201ENST00000240055 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2A3-208ENST00000570845 604 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2A3-210ENST00000572116 429 ntTSL 1 (best)12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2A3-213ENST00000574202 230 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 VPS28-214ENST00000531032 573 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 DPP9-201ENST00000262960 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 STAT3-211ENST00000585517 3319 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PANK2-203ENST00000464452 771 ntTSL 312.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CHST11-204ENST00000549016 573 ntTSL 412.07□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TOM1-202ENST00000395736 560 ntTSL 411.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CHD3-216ENST00000573936 749 ntTSL 311.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHF20L1-206ENST00000395376 2236 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CHD3-208ENST00000470531 3744 ntTSL 211.62□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 IMMP2L-206ENST00000452753 421 ntTSL 511.42□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 DPP9-203ENST00000594671 3851 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF83-218ENST00000601257 704 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF442-204ENST00000462995 536 ntTSL 410.96□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PPP3CB-202ENST00000360663 3501 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GAB2-205ENST00000528886 543 ntTSL 410.35□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 MTPN-202ENST00000435723 879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF83-206ENST00000595171 578 ntTSL 49.71□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF83-219ENST00000602232 575 ntTSL 48.96□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF442-202ENST00000424168 567 ntTSL 48.48□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 NFYB-203ENST00000550881 893 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF83-208ENST00000596440 561 ntTSL 48.11□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PPP3CB-205ENST00000430762 608 ntTSL 37.77□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 47.35□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.04□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHF20L1-219ENST00000522580 621 ntTSL 36.9□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 GABBR1-209ENST00000473774 582 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHF20L1-215ENST00000486199 1633 ntTSL 26.56□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-207ENST00000504612 3148 ntTSL 25.72□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 36.1
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