RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490566.1

TNS1-217, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-217ENST00000490566 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
TNS1-217ENST00000490566 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.27■■□□□ 1.8
TNS1-217ENST00000490566 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TNS1-217ENST00000490566 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.02■■□□□ 1.28
TNS1-217ENST00000490566 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TNS1-217ENST00000490566 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.53■■□□□ 1.04
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TNS1-217ENST00000490566 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.07■□□□□ 0.64
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TNS1-217ENST00000490566 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.72■□□□□ 0.59
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TNS1-217ENST00000490566 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.84■□□□□ 0.45
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TNS1-217ENST00000490566 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.8■□□□□ 0.44
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TNS1-217ENST00000490566 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
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TNS1-217ENST00000490566 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.81■□□□□ 0.28
TNS1-217ENST00000490566 TOP2BQ02880 1626 aa16.78■□□□□ 0.28
TNS1-217ENST00000490566 EEA1Q15075 1411 aa16.77■□□□□ 0.27
TNS1-217ENST00000490566 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.76■□□□□ 0.27
TNS1-217ENST00000490566 CFTRP13569 1480 aa16.75■□□□□ 0.27
TNS1-217ENST00000490566 SOGA1O94964 1423 aa16.73■□□□□ 0.27
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TNS1-217ENST00000490566 CUX1P39880 1505 aa16.64■□□□□ 0.25
TNS1-217ENST00000490566 KIF21BO75037 1637 aa16.63■□□□□ 0.25
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TNS1-217ENST00000490566 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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TNS1-217ENST00000490566 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.52■□□□□ 0.24
TNS1-217ENST00000490566 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.49■□□□□ 0.23
TNS1-217ENST00000490566 CEP162Q5TB80 1403 aa16.48■□□□□ 0.23
TNS1-217ENST00000490566 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.46■□□□□ 0.23
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TNS1-217ENST00000490566 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.44■□□□□ 0.22
TNS1-217ENST00000490566 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.43■□□□□ 0.22
TNS1-217ENST00000490566 NESP48681 1621 aa16.43■□□□□ 0.22
TNS1-217ENST00000490566 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.4■□□□□ 0.22
TNS1-217ENST00000490566 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.4■□□□□ 0.22
TNS1-217ENST00000490566 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TNS1-217ENST00000490566 POTEDQ86YR6 584 aa16.39■□□□□ 0.21
TNS1-217ENST00000490566 KIF27Q86VH2 1401 aa16.39■□□□□ 0.21
TNS1-217ENST00000490566 PRXQ9BXM0 1461 aa16.38■□□□□ 0.21
TNS1-217ENST00000490566 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.36■□□□□ 0.21
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