Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN4Q96Q06 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN4Q96Q06 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PLIN4Q96Q06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PLIN4Q96Q06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PLIN4Q96Q06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN4Q96Q06 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLIN4Q96Q06 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PLIN4Q96Q06 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PLIN4Q96Q06 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLIN4Q96Q06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PLIN4Q96Q06 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PLIN4Q96Q06 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PLIN4Q96Q06 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PLIN4Q96Q06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PLIN4Q96Q06 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PLIN4Q96Q06 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PLIN4Q96Q06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PLIN4Q96Q06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PLIN4Q96Q06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PLIN4Q96Q06 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PLIN4Q96Q06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PLIN4Q96Q06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PLIN4Q96Q06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PLIN4Q96Q06 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PLIN4Q96Q06 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PLIN4Q96Q06 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PLIN4Q96Q06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PLIN4Q96Q06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PLIN4Q96Q06 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PLIN4Q96Q06 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PLIN4Q96Q06 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PLIN4Q96Q06 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PLIN4Q96Q06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PLIN4Q96Q06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PLIN4Q96Q06 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PLIN4Q96Q06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PLIN4Q96Q06 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PLIN4Q96Q06 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PLIN4Q96Q06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PLIN4Q96Q06 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PLIN4Q96Q06 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PLIN4Q96Q06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLIN4Q96Q06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLIN4Q96Q06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PLIN4Q96Q06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PLIN4Q96Q06 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms