Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PLIN4Q96Q06 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PLIN4Q96Q06 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PLIN4Q96Q06 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PLIN4Q96Q06 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PLIN4Q96Q06 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PLIN4Q96Q06 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
PLIN4Q96Q06 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PLIN4Q96Q06 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PLIN4Q96Q06 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PLIN4Q96Q06 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PLIN4Q96Q06 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PLIN4Q96Q06 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PLIN4Q96Q06 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PLIN4Q96Q06 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PLIN4Q96Q06 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PLIN4Q96Q06 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PLIN4Q96Q06 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PLIN4Q96Q06 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PLIN4Q96Q06 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PLIN4Q96Q06 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PLIN4Q96Q06 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PLIN4Q96Q06 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PLIN4Q96Q06 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PLIN4Q96Q06 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PLIN4Q96Q06 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PLIN4Q96Q06 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PLIN4Q96Q06 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PLIN4Q96Q06 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PLIN4Q96Q06 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PLIN4Q96Q06 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLIN4Q96Q06 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLIN4Q96Q06 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PLIN4Q96Q06 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLIN4Q96Q06 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PLIN4Q96Q06 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PLIN4Q96Q06 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PLIN4Q96Q06 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLIN4Q96Q06 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PLIN4Q96Q06 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PLIN4Q96Q06 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PLIN4Q96Q06 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PLIN4Q96Q06 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PLIN4Q96Q06 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PLIN4Q96Q06 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PLIN4Q96Q06 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PLIN4Q96Q06 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PLIN4Q96Q06 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PLIN4Q96Q06 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PLIN4Q96Q06 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PLIN4Q96Q06 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
PLIN4Q96Q06 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
PLIN4Q96Q06 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PLIN4Q96Q06 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PLIN4Q96Q06 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PLIN4Q96Q06 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PLIN4Q96Q06 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLIN4Q96Q06 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLIN4Q96Q06 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLIN4Q96Q06 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLIN4Q96Q06 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PLIN4Q96Q06 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PLIN4Q96Q06 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PLIN4Q96Q06 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PLIN4Q96Q06 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PLIN4Q96Q06 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PLIN4Q96Q06 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PLIN4Q96Q06 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PLIN4Q96Q06 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PLIN4Q96Q06 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PLIN4Q96Q06 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PLIN4Q96Q06 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PLIN4Q96Q06 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PLIN4Q96Q06 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PLIN4Q96Q06 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PLIN4Q96Q06 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PLIN4Q96Q06 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PLIN4Q96Q06 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PLIN4Q96Q06 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PLIN4Q96Q06 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PLIN4Q96Q06 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PLIN4Q96Q06 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PLIN4Q96Q06 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PLIN4Q96Q06 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PLIN4Q96Q06 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PLIN4Q96Q06 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PLIN4Q96Q06 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PLIN4Q96Q06 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PLIN4Q96Q06 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PLIN4Q96Q06 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PLIN4Q96Q06 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PLIN4Q96Q06 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLIN4Q96Q06 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PLIN4Q96Q06 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PLIN4Q96Q06 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLIN4Q96Q06 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PLIN4Q96Q06 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PLIN4Q96Q06 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PLIN4Q96Q06 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PLIN4Q96Q06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms