Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC2Q96PR1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC2Q96PR1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC2Q96PR1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC2Q96PR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC2Q96PR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNC2Q96PR1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNC2Q96PR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNC2Q96PR1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNC2Q96PR1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNC2Q96PR1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNC2Q96PR1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNC2Q96PR1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNC2Q96PR1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNC2Q96PR1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNC2Q96PR1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNC2Q96PR1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNC2Q96PR1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNC2Q96PR1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNC2Q96PR1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms